Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ4

Ube2j1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2j1Q9JJZ4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2j1Q9JJZ4 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2j1Q9JJZ4 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2j1Q9JJZ4 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2j1Q9JJZ4 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2j1Q9JJZ4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2j1Q9JJZ4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Ube2j1Q9JJZ4 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2j1Q9JJZ4 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2j1Q9JJZ4 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2j1Q9JJZ4 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2j1Q9JJZ4 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2j1Q9JJZ4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2j1Q9JJZ4 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ube2j1Q9JJZ4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2j1Q9JJZ4 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2j1Q9JJZ4 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2j1Q9JJZ4 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2j1Q9JJZ4 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2j1Q9JJZ4 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2j1Q9JJZ4 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2j1Q9JJZ4 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2j1Q9JJZ4 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2j1Q9JJZ4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2j1Q9JJZ4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2j1Q9JJZ4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2j1Q9JJZ4 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2j1Q9JJZ4 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2j1Q9JJZ4 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2j1Q9JJZ4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2j1Q9JJZ4 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2j1Q9JJZ4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2j1Q9JJZ4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2j1Q9JJZ4 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Ube2j1Q9JJZ4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2j1Q9JJZ4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2j1Q9JJZ4 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2j1Q9JJZ4 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2j1Q9JJZ4 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Ube2j1Q9JJZ4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Ube2j1Q9JJZ4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2j1Q9JJZ4 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2j1Q9JJZ4 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Ube2j1Q9JJZ4 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Ube2j1Q9JJZ4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2j1Q9JJZ4 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Ube2j1Q9JJZ4 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2j1Q9JJZ4 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2j1Q9JJZ4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2j1Q9JJZ4 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2j1Q9JJZ4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Ube2j1Q9JJZ4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Ube2j1Q9JJZ4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2j1Q9JJZ4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2j1Q9JJZ4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2j1Q9JJZ4 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2j1Q9JJZ4 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2j1Q9JJZ4 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2j1Q9JJZ4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2j1Q9JJZ4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2j1Q9JJZ4 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2j1Q9JJZ4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Ube2j1Q9JJZ4 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2j1Q9JJZ4 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2j1Q9JJZ4 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Ube2j1Q9JJZ4 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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