Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ94

Ssna1, Sjoegren syndrome nuclear autoantigen 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ssna1Q9JJ94 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssna1Q9JJ94 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssna1Q9JJ94 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Ssna1Q9JJ94 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Ssna1Q9JJ94 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssna1Q9JJ94 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Ssna1Q9JJ94 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Ssna1Q9JJ94 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssna1Q9JJ94 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssna1Q9JJ94 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssna1Q9JJ94 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Ssna1Q9JJ94 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Ssna1Q9JJ94 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssna1Q9JJ94 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssna1Q9JJ94 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssna1Q9JJ94 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssna1Q9JJ94 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssna1Q9JJ94 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssna1Q9JJ94 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssna1Q9JJ94 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssna1Q9JJ94 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssna1Q9JJ94 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssna1Q9JJ94 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssna1Q9JJ94 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssna1Q9JJ94 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssna1Q9JJ94 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssna1Q9JJ94 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Ssna1Q9JJ94 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssna1Q9JJ94 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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