Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIN6

Kcnmb4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnmb4Q9JIN6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms