Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESW8

Pgpep1, Pyroglutamyl-peptidase 1, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgpep1Q9ESW8 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pgpep1Q9ESW8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pgpep1Q9ESW8 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pgpep1Q9ESW8 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pgpep1Q9ESW8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pgpep1Q9ESW8 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Pgpep1Q9ESW8 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Pgpep1Q9ESW8 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pgpep1Q9ESW8 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pgpep1Q9ESW8 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pgpep1Q9ESW8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Pgpep1Q9ESW8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pgpep1Q9ESW8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pgpep1Q9ESW8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pgpep1Q9ESW8 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pgpep1Q9ESW8 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pgpep1Q9ESW8 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pgpep1Q9ESW8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pgpep1Q9ESW8 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pgpep1Q9ESW8 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pgpep1Q9ESW8 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pgpep1Q9ESW8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pgpep1Q9ESW8 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pgpep1Q9ESW8 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pgpep1Q9ESW8 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pgpep1Q9ESW8 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pgpep1Q9ESW8 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pgpep1Q9ESW8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pgpep1Q9ESW8 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pgpep1Q9ESW8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pgpep1Q9ESW8 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pgpep1Q9ESW8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pgpep1Q9ESW8 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Pgpep1Q9ESW8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Pgpep1Q9ESW8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Pgpep1Q9ESW8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pgpep1Q9ESW8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pgpep1Q9ESW8 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Pgpep1Q9ESW8 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Pgpep1Q9ESW8 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pgpep1Q9ESW8 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pgpep1Q9ESW8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pgpep1Q9ESW8 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Pgpep1Q9ESW8 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pgpep1Q9ESW8 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Pgpep1Q9ESW8 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pgpep1Q9ESW8 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pgpep1Q9ESW8 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pgpep1Q9ESW8 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pgpep1Q9ESW8 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pgpep1Q9ESW8 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pgpep1Q9ESW8 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pgpep1Q9ESW8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pgpep1Q9ESW8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pgpep1Q9ESW8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pgpep1Q9ESW8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pgpep1Q9ESW8 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pgpep1Q9ESW8 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pgpep1Q9ESW8 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pgpep1Q9ESW8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pgpep1Q9ESW8 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pgpep1Q9ESW8 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pgpep1Q9ESW8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pgpep1Q9ESW8 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms