Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rpgrip1Q9EPQ2 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rpgrip1Q9EPQ2 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rpgrip1Q9EPQ2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rpgrip1Q9EPQ2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rpgrip1Q9EPQ2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rpgrip1Q9EPQ2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rpgrip1Q9EPQ2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rpgrip1Q9EPQ2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rpgrip1Q9EPQ2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms