Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC53

Cpne8, Copine-8, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne8Q9DC53 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Cpne8Q9DC53 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cpne8Q9DC53 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cpne8Q9DC53 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cpne8Q9DC53 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cpne8Q9DC53 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cpne8Q9DC53 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cpne8Q9DC53 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cpne8Q9DC53 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cpne8Q9DC53 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cpne8Q9DC53 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cpne8Q9DC53 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Cpne8Q9DC53 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cpne8Q9DC53 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cpne8Q9DC53 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cpne8Q9DC53 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cpne8Q9DC53 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cpne8Q9DC53 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cpne8Q9DC53 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cpne8Q9DC53 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cpne8Q9DC53 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cpne8Q9DC53 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cpne8Q9DC53 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cpne8Q9DC53 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cpne8Q9DC53 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cpne8Q9DC53 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cpne8Q9DC53 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cpne8Q9DC53 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cpne8Q9DC53 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cpne8Q9DC53 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cpne8Q9DC53 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cpne8Q9DC53 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cpne8Q9DC53 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cpne8Q9DC53 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Cpne8Q9DC53 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cpne8Q9DC53 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cpne8Q9DC53 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cpne8Q9DC53 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cpne8Q9DC53 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cpne8Q9DC53 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cpne8Q9DC53 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Cpne8Q9DC53 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cpne8Q9DC53 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cpne8Q9DC53 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cpne8Q9DC53 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cpne8Q9DC53 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cpne8Q9DC53 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cpne8Q9DC53 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cpne8Q9DC53 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cpne8Q9DC53 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cpne8Q9DC53 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cpne8Q9DC53 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cpne8Q9DC53 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cpne8Q9DC53 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cpne8Q9DC53 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cpne8Q9DC53 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cpne8Q9DC53 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cpne8Q9DC53 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cpne8Q9DC53 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cpne8Q9DC53 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cpne8Q9DC53 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cpne8Q9DC53 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cpne8Q9DC53 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cpne8Q9DC53 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cpne8Q9DC53 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cpne8Q9DC53 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cpne8Q9DC53 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cpne8Q9DC53 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cpne8Q9DC53 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cpne8Q9DC53 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cpne8Q9DC53 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cpne8Q9DC53 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cpne8Q9DC53 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cpne8Q9DC53 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cpne8Q9DC53 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cpne8Q9DC53 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cpne8Q9DC53 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cpne8Q9DC53 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cpne8Q9DC53 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cpne8Q9DC53 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cpne8Q9DC53 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cpne8Q9DC53 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cpne8Q9DC53 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cpne8Q9DC53 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cpne8Q9DC53 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cpne8Q9DC53 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cpne8Q9DC53 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cpne8Q9DC53 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cpne8Q9DC53 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cpne8Q9DC53 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cpne8Q9DC53 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cpne8Q9DC53 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cpne8Q9DC53 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cpne8Q9DC53 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cpne8Q9DC53 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cpne8Q9DC53 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cpne8Q9DC53 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cpne8Q9DC53 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cpne8Q9DC53 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cpne8Q9DC53 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms