Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syde1Q9DBZ9 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syde1Q9DBZ9 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syde1Q9DBZ9 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syde1Q9DBZ9 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syde1Q9DBZ9 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syde1Q9DBZ9 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syde1Q9DBZ9 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syde1Q9DBZ9 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syde1Q9DBZ9 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syde1Q9DBZ9 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Syde1Q9DBZ9 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syde1Q9DBZ9 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syde1Q9DBZ9 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syde1Q9DBZ9 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syde1Q9DBZ9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syde1Q9DBZ9 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syde1Q9DBZ9 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syde1Q9DBZ9 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syde1Q9DBZ9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syde1Q9DBZ9 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syde1Q9DBZ9 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syde1Q9DBZ9 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syde1Q9DBZ9 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Syde1Q9DBZ9 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syde1Q9DBZ9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syde1Q9DBZ9 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syde1Q9DBZ9 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syde1Q9DBZ9 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syde1Q9DBZ9 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Syde1Q9DBZ9 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syde1Q9DBZ9 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syde1Q9DBZ9 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syde1Q9DBZ9 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syde1Q9DBZ9 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syde1Q9DBZ9 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syde1Q9DBZ9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syde1Q9DBZ9 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syde1Q9DBZ9 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syde1Q9DBZ9 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syde1Q9DBZ9 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syde1Q9DBZ9 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syde1Q9DBZ9 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syde1Q9DBZ9 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syde1Q9DBZ9 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syde1Q9DBZ9 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syde1Q9DBZ9 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syde1Q9DBZ9 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Syde1Q9DBZ9 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Syde1Q9DBZ9 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Syde1Q9DBZ9 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Syde1Q9DBZ9 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Syde1Q9DBZ9 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Syde1Q9DBZ9 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Syde1Q9DBZ9 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Syde1Q9DBZ9 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Syde1Q9DBZ9 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Syde1Q9DBZ9 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Syde1Q9DBZ9 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Syde1Q9DBZ9 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Syde1Q9DBZ9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Syde1Q9DBZ9 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Syde1Q9DBZ9 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Syde1Q9DBZ9 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Syde1Q9DBZ9 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Syde1Q9DBZ9 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Syde1Q9DBZ9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Syde1Q9DBZ9 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Syde1Q9DBZ9 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Syde1Q9DBZ9 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Syde1Q9DBZ9 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Syde1Q9DBZ9 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Syde1Q9DBZ9 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Syde1Q9DBZ9 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Syde1Q9DBZ9 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Syde1Q9DBZ9 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Syde1Q9DBZ9 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Syde1Q9DBZ9 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Syde1Q9DBZ9 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Syde1Q9DBZ9 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Syde1Q9DBZ9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Syde1Q9DBZ9 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Syde1Q9DBZ9 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Syde1Q9DBZ9 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Syde1Q9DBZ9 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Syde1Q9DBZ9 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Syde1Q9DBZ9 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Syde1Q9DBZ9 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Syde1Q9DBZ9 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syde1Q9DBZ9 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syde1Q9DBZ9 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syde1Q9DBZ9 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Syde1Q9DBZ9 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syde1Q9DBZ9 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syde1Q9DBZ9 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syde1Q9DBZ9 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syde1Q9DBZ9 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syde1Q9DBZ9 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syde1Q9DBZ9 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syde1Q9DBZ9 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms