Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBY5

Cbx6, Chromobox protein homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx6Q9DBY5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cbx6Q9DBY5 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cbx6Q9DBY5 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cbx6Q9DBY5 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cbx6Q9DBY5 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Cbx6Q9DBY5 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cbx6Q9DBY5 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cbx6Q9DBY5 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cbx6Q9DBY5 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cbx6Q9DBY5 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cbx6Q9DBY5 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cbx6Q9DBY5 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cbx6Q9DBY5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cbx6Q9DBY5 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Cbx6Q9DBY5 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cbx6Q9DBY5 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cbx6Q9DBY5 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cbx6Q9DBY5 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cbx6Q9DBY5 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cbx6Q9DBY5 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cbx6Q9DBY5 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cbx6Q9DBY5 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cbx6Q9DBY5 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cbx6Q9DBY5 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cbx6Q9DBY5 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Cbx6Q9DBY5 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cbx6Q9DBY5 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cbx6Q9DBY5 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cbx6Q9DBY5 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cbx6Q9DBY5 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cbx6Q9DBY5 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cbx6Q9DBY5 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cbx6Q9DBY5 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cbx6Q9DBY5 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cbx6Q9DBY5 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cbx6Q9DBY5 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cbx6Q9DBY5 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cbx6Q9DBY5 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cbx6Q9DBY5 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cbx6Q9DBY5 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cbx6Q9DBY5 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cbx6Q9DBY5 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Cbx6Q9DBY5 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cbx6Q9DBY5 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cbx6Q9DBY5 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cbx6Q9DBY5 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cbx6Q9DBY5 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cbx6Q9DBY5 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Cbx6Q9DBY5 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Cbx6Q9DBY5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Cbx6Q9DBY5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cbx6Q9DBY5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cbx6Q9DBY5 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cbx6Q9DBY5 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cbx6Q9DBY5 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cbx6Q9DBY5 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cbx6Q9DBY5 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cbx6Q9DBY5 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cbx6Q9DBY5 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cbx6Q9DBY5 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cbx6Q9DBY5 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cbx6Q9DBY5 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cbx6Q9DBY5 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cbx6Q9DBY5 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cbx6Q9DBY5 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cbx6Q9DBY5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cbx6Q9DBY5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cbx6Q9DBY5 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cbx6Q9DBY5 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cbx6Q9DBY5 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cbx6Q9DBY5 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cbx6Q9DBY5 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cbx6Q9DBY5 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cbx6Q9DBY5 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cbx6Q9DBY5 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cbx6Q9DBY5 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cbx6Q9DBY5 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cbx6Q9DBY5 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cbx6Q9DBY5 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cbx6Q9DBY5 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cbx6Q9DBY5 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cbx6Q9DBY5 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cbx6Q9DBY5 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cbx6Q9DBY5 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cbx6Q9DBY5 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cbx6Q9DBY5 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Cbx6Q9DBY5 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cbx6Q9DBY5 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cbx6Q9DBY5 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cbx6Q9DBY5 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cbx6Q9DBY5 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Cbx6Q9DBY5 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cbx6Q9DBY5 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cbx6Q9DBY5 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cbx6Q9DBY5 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cbx6Q9DBY5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cbx6Q9DBY5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cbx6Q9DBY5 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cbx6Q9DBY5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cbx6Q9DBY5 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms