Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBE9

Ftsj3, pre-rRNA processing protein FTSJ3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ftsj3Q9DBE9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ftsj3Q9DBE9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ftsj3Q9DBE9 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ftsj3Q9DBE9 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ftsj3Q9DBE9 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ftsj3Q9DBE9 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ftsj3Q9DBE9 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ftsj3Q9DBE9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ftsj3Q9DBE9 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ftsj3Q9DBE9 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ftsj3Q9DBE9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ftsj3Q9DBE9 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ftsj3Q9DBE9 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ftsj3Q9DBE9 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ftsj3Q9DBE9 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ftsj3Q9DBE9 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ftsj3Q9DBE9 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ftsj3Q9DBE9 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ftsj3Q9DBE9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ftsj3Q9DBE9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ftsj3Q9DBE9 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ftsj3Q9DBE9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ftsj3Q9DBE9 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ftsj3Q9DBE9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ftsj3Q9DBE9 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ftsj3Q9DBE9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ftsj3Q9DBE9 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ftsj3Q9DBE9 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ftsj3Q9DBE9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ftsj3Q9DBE9 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ftsj3Q9DBE9 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ftsj3Q9DBE9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ftsj3Q9DBE9 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ftsj3Q9DBE9 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ftsj3Q9DBE9 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ftsj3Q9DBE9 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ftsj3Q9DBE9 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ftsj3Q9DBE9 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ftsj3Q9DBE9 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ftsj3Q9DBE9 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ftsj3Q9DBE9 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ftsj3Q9DBE9 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ftsj3Q9DBE9 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ftsj3Q9DBE9 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ftsj3Q9DBE9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ftsj3Q9DBE9 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ftsj3Q9DBE9 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ftsj3Q9DBE9 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ftsj3Q9DBE9 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ftsj3Q9DBE9 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ftsj3Q9DBE9 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ftsj3Q9DBE9 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ftsj3Q9DBE9 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ftsj3Q9DBE9 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ftsj3Q9DBE9 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ftsj3Q9DBE9 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ftsj3Q9DBE9 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ftsj3Q9DBE9 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ftsj3Q9DBE9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ftsj3Q9DBE9 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ftsj3Q9DBE9 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ftsj3Q9DBE9 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ftsj3Q9DBE9 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ftsj3Q9DBE9 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ftsj3Q9DBE9 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ftsj3Q9DBE9 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ftsj3Q9DBE9 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ftsj3Q9DBE9 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ftsj3Q9DBE9 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ftsj3Q9DBE9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ftsj3Q9DBE9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ftsj3Q9DBE9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ftsj3Q9DBE9 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ftsj3Q9DBE9 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ftsj3Q9DBE9 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ftsj3Q9DBE9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ftsj3Q9DBE9 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ftsj3Q9DBE9 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ftsj3Q9DBE9 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ftsj3Q9DBE9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ftsj3Q9DBE9 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ftsj3Q9DBE9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ftsj3Q9DBE9 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ftsj3Q9DBE9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ftsj3Q9DBE9 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ftsj3Q9DBE9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ftsj3Q9DBE9 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ftsj3Q9DBE9 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ftsj3Q9DBE9 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ftsj3Q9DBE9 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ftsj3Q9DBE9 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ftsj3Q9DBE9 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ftsj3Q9DBE9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ftsj3Q9DBE9 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ftsj3Q9DBE9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ftsj3Q9DBE9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ftsj3Q9DBE9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ftsj3Q9DBE9 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ftsj3Q9DBE9 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ftsj3Q9DBE9 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms