Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB50

Ap1s2, AP-1 complex subunit sigma-2, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap1s2Q9DB50 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms