Protein–RNA interactions for Protein: Q9D898

Arpc5l, Actin-related protein 2/3 complex subunit 5-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arpc5lQ9D898 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arpc5lQ9D898 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arpc5lQ9D898 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arpc5lQ9D898 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arpc5lQ9D898 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arpc5lQ9D898 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arpc5lQ9D898 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arpc5lQ9D898 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arpc5lQ9D898 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arpc5lQ9D898 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arpc5lQ9D898 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arpc5lQ9D898 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arpc5lQ9D898 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arpc5lQ9D898 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arpc5lQ9D898 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arpc5lQ9D898 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arpc5lQ9D898 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arpc5lQ9D898 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arpc5lQ9D898 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arpc5lQ9D898 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arpc5lQ9D898 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arpc5lQ9D898 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arpc5lQ9D898 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arpc5lQ9D898 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arpc5lQ9D898 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arpc5lQ9D898 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arpc5lQ9D898 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arpc5lQ9D898 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arpc5lQ9D898 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arpc5lQ9D898 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arpc5lQ9D898 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arpc5lQ9D898 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arpc5lQ9D898 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arpc5lQ9D898 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arpc5lQ9D898 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Arpc5lQ9D898 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arpc5lQ9D898 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arpc5lQ9D898 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arpc5lQ9D898 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms