Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cldn22Q9D7U6 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cldn22Q9D7U6 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cldn22Q9D7U6 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cldn22Q9D7U6 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cldn22Q9D7U6 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cldn22Q9D7U6 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cldn22Q9D7U6 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cldn22Q9D7U6 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cldn22Q9D7U6 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cldn22Q9D7U6 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cldn22Q9D7U6 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cldn22Q9D7U6 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cldn22Q9D7U6 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cldn22Q9D7U6 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cldn22Q9D7U6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn22Q9D7U6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn22Q9D7U6 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn22Q9D7U6 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn22Q9D7U6 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn22Q9D7U6 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn22Q9D7U6 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn22Q9D7U6 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn22Q9D7U6 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn22Q9D7U6 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn22Q9D7U6 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn22Q9D7U6 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn22Q9D7U6 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn22Q9D7U6 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn22Q9D7U6 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn22Q9D7U6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn22Q9D7U6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn22Q9D7U6 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn22Q9D7U6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn22Q9D7U6 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn22Q9D7U6 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn22Q9D7U6 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn22Q9D7U6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn22Q9D7U6 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn22Q9D7U6 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn22Q9D7U6 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn22Q9D7U6 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn22Q9D7U6 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn22Q9D7U6 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn22Q9D7U6 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn22Q9D7U6 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn22Q9D7U6 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn22Q9D7U6 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn22Q9D7U6 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn22Q9D7U6 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn22Q9D7U6 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn22Q9D7U6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn22Q9D7U6 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn22Q9D7U6 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn22Q9D7U6 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn22Q9D7U6 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn22Q9D7U6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn22Q9D7U6 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn22Q9D7U6 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn22Q9D7U6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn22Q9D7U6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn22Q9D7U6 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn22Q9D7U6 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn22Q9D7U6 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn22Q9D7U6 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn22Q9D7U6 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn22Q9D7U6 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn22Q9D7U6 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn22Q9D7U6 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn22Q9D7U6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn22Q9D7U6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn22Q9D7U6 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn22Q9D7U6 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn22Q9D7U6 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn22Q9D7U6 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn22Q9D7U6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn22Q9D7U6 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn22Q9D7U6 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn22Q9D7U6 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn22Q9D7U6 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn22Q9D7U6 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn22Q9D7U6 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn22Q9D7U6 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn22Q9D7U6 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn22Q9D7U6 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn22Q9D7U6 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn22Q9D7U6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn22Q9D7U6 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn22Q9D7U6 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn22Q9D7U6 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn22Q9D7U6 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn22Q9D7U6 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn22Q9D7U6 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn22Q9D7U6 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn22Q9D7U6 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn22Q9D7U6 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn22Q9D7U6 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn22Q9D7U6 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn22Q9D7U6 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn22Q9D7U6 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms