Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y4

Borcs8, BLOC-1-related complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs8Q9D6Y4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Borcs8Q9D6Y4 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Borcs8Q9D6Y4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Borcs8Q9D6Y4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Borcs8Q9D6Y4 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Borcs8Q9D6Y4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Borcs8Q9D6Y4 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Borcs8Q9D6Y4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Borcs8Q9D6Y4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Borcs8Q9D6Y4 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Borcs8Q9D6Y4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Borcs8Q9D6Y4 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Borcs8Q9D6Y4 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Borcs8Q9D6Y4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Borcs8Q9D6Y4 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Borcs8Q9D6Y4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Borcs8Q9D6Y4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Borcs8Q9D6Y4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Borcs8Q9D6Y4 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Borcs8Q9D6Y4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Borcs8Q9D6Y4 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Borcs8Q9D6Y4 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Borcs8Q9D6Y4 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Borcs8Q9D6Y4 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Borcs8Q9D6Y4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Borcs8Q9D6Y4 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Borcs8Q9D6Y4 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Borcs8Q9D6Y4 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Borcs8Q9D6Y4 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Borcs8Q9D6Y4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Borcs8Q9D6Y4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Borcs8Q9D6Y4 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Borcs8Q9D6Y4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Borcs8Q9D6Y4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Borcs8Q9D6Y4 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Borcs8Q9D6Y4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Borcs8Q9D6Y4 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Borcs8Q9D6Y4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Borcs8Q9D6Y4 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Borcs8Q9D6Y4 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Borcs8Q9D6Y4 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Borcs8Q9D6Y4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Borcs8Q9D6Y4 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Borcs8Q9D6Y4 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Borcs8Q9D6Y4 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Borcs8Q9D6Y4 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Borcs8Q9D6Y4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Borcs8Q9D6Y4 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Borcs8Q9D6Y4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Borcs8Q9D6Y4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Borcs8Q9D6Y4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Borcs8Q9D6Y4 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Borcs8Q9D6Y4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Borcs8Q9D6Y4 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Borcs8Q9D6Y4 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Borcs8Q9D6Y4 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Borcs8Q9D6Y4 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Borcs8Q9D6Y4 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Borcs8Q9D6Y4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Borcs8Q9D6Y4 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Borcs8Q9D6Y4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Borcs8Q9D6Y4 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Borcs8Q9D6Y4 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Borcs8Q9D6Y4 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Borcs8Q9D6Y4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Borcs8Q9D6Y4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Borcs8Q9D6Y4 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Borcs8Q9D6Y4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Borcs8Q9D6Y4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Borcs8Q9D6Y4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Borcs8Q9D6Y4 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Borcs8Q9D6Y4 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Borcs8Q9D6Y4 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Borcs8Q9D6Y4 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Borcs8Q9D6Y4 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Borcs8Q9D6Y4 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Borcs8Q9D6Y4 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Borcs8Q9D6Y4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Borcs8Q9D6Y4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Borcs8Q9D6Y4 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Borcs8Q9D6Y4 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Borcs8Q9D6Y4 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Borcs8Q9D6Y4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Borcs8Q9D6Y4 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Borcs8Q9D6Y4 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Borcs8Q9D6Y4 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Borcs8Q9D6Y4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Borcs8Q9D6Y4 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Borcs8Q9D6Y4 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Borcs8Q9D6Y4 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Borcs8Q9D6Y4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Borcs8Q9D6Y4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Borcs8Q9D6Y4 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Borcs8Q9D6Y4 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Borcs8Q9D6Y4 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Borcs8Q9D6Y4 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Borcs8Q9D6Y4 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Borcs8Q9D6Y4 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Borcs8Q9D6Y4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Borcs8Q9D6Y4 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 133.8 ms