Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Q4

4930578G10Rik, RIKEN cDNA 4930578G10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930578G10RikQ9D4Q4 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
4930578G10RikQ9D4Q4 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930578G10RikQ9D4Q4 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930578G10RikQ9D4Q4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930578G10RikQ9D4Q4 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930578G10RikQ9D4Q4 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930578G10RikQ9D4Q4 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
4930578G10RikQ9D4Q4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930578G10RikQ9D4Q4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930578G10RikQ9D4Q4 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930578G10RikQ9D4Q4 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930578G10RikQ9D4Q4 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930578G10RikQ9D4Q4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930578G10RikQ9D4Q4 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930578G10RikQ9D4Q4 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930578G10RikQ9D4Q4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930578G10RikQ9D4Q4 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930578G10RikQ9D4Q4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930578G10RikQ9D4Q4 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930578G10RikQ9D4Q4 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930578G10RikQ9D4Q4 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
4930578G10RikQ9D4Q4 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
4930578G10RikQ9D4Q4 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930578G10RikQ9D4Q4 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
4930578G10RikQ9D4Q4 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930578G10RikQ9D4Q4 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930578G10RikQ9D4Q4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930578G10RikQ9D4Q4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930578G10RikQ9D4Q4 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930578G10RikQ9D4Q4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930578G10RikQ9D4Q4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930578G10RikQ9D4Q4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930578G10RikQ9D4Q4 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930578G10RikQ9D4Q4 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930578G10RikQ9D4Q4 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930578G10RikQ9D4Q4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930578G10RikQ9D4Q4 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930578G10RikQ9D4Q4 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
4930578G10RikQ9D4Q4 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
4930578G10RikQ9D4Q4 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930578G10RikQ9D4Q4 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930578G10RikQ9D4Q4 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930578G10RikQ9D4Q4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930578G10RikQ9D4Q4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
4930578G10RikQ9D4Q4 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930578G10RikQ9D4Q4 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930578G10RikQ9D4Q4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930578G10RikQ9D4Q4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930578G10RikQ9D4Q4 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930578G10RikQ9D4Q4 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930578G10RikQ9D4Q4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930578G10RikQ9D4Q4 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
4930578G10RikQ9D4Q4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930578G10RikQ9D4Q4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930578G10RikQ9D4Q4 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930578G10RikQ9D4Q4 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
4930578G10RikQ9D4Q4 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930578G10RikQ9D4Q4 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930578G10RikQ9D4Q4 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930578G10RikQ9D4Q4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930578G10RikQ9D4Q4 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930578G10RikQ9D4Q4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930578G10RikQ9D4Q4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930578G10RikQ9D4Q4 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930578G10RikQ9D4Q4 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930578G10RikQ9D4Q4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930578G10RikQ9D4Q4 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930578G10RikQ9D4Q4 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930578G10RikQ9D4Q4 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930578G10RikQ9D4Q4 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930578G10RikQ9D4Q4 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930578G10RikQ9D4Q4 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930578G10RikQ9D4Q4 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930578G10RikQ9D4Q4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
4930578G10RikQ9D4Q4 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930578G10RikQ9D4Q4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930578G10RikQ9D4Q4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930578G10RikQ9D4Q4 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930578G10RikQ9D4Q4 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930578G10RikQ9D4Q4 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930578G10RikQ9D4Q4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930578G10RikQ9D4Q4 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930578G10RikQ9D4Q4 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930578G10RikQ9D4Q4 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930578G10RikQ9D4Q4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930578G10RikQ9D4Q4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930578G10RikQ9D4Q4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930578G10RikQ9D4Q4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930578G10RikQ9D4Q4 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms