Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X4

4933428G20Rik, RIKEN cDNA 4933428G20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428G20RikQ9D3X4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms