Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

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Length 431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt20Q9D312 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt20Q9D312 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt20Q9D312 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt20Q9D312 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt20Q9D312 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt20Q9D312 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt20Q9D312 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt20Q9D312 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt20Q9D312 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt20Q9D312 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt20Q9D312 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt20Q9D312 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt20Q9D312 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt20Q9D312 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt20Q9D312 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt20Q9D312 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt20Q9D312 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt20Q9D312 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt20Q9D312 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt20Q9D312 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt20Q9D312 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt20Q9D312 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt20Q9D312 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt20Q9D312 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt20Q9D312 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt20Q9D312 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt20Q9D312 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt20Q9D312 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt20Q9D312 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt20Q9D312 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt20Q9D312 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt20Q9D312 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt20Q9D312 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt20Q9D312 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt20Q9D312 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt20Q9D312 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt20Q9D312 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt20Q9D312 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt20Q9D312 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt20Q9D312 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt20Q9D312 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt20Q9D312 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt20Q9D312 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt20Q9D312 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krt20Q9D312 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krt20Q9D312 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krt20Q9D312 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Krt20Q9D312 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krt20Q9D312 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krt20Q9D312 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Krt20Q9D312 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krt20Q9D312 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krt20Q9D312 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krt20Q9D312 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krt20Q9D312 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krt20Q9D312 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krt20Q9D312 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krt20Q9D312 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krt20Q9D312 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krt20Q9D312 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krt20Q9D312 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krt20Q9D312 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krt20Q9D312 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krt20Q9D312 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krt20Q9D312 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Krt20Q9D312 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Krt20Q9D312 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Krt20Q9D312 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Krt20Q9D312 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Krt20Q9D312 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Krt20Q9D312 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Krt20Q9D312 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Krt20Q9D312 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Krt20Q9D312 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Krt20Q9D312 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Krt20Q9D312 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Krt20Q9D312 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Krt20Q9D312 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Krt20Q9D312 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Krt20Q9D312 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Krt20Q9D312 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Krt20Q9D312 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Krt20Q9D312 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Krt20Q9D312 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Krt20Q9D312 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Krt20Q9D312 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Krt20Q9D312 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Krt20Q9D312 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Krt20Q9D312 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Krt20Q9D312 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Krt20Q9D312 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Krt20Q9D312 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Krt20Q9D312 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Krt20Q9D312 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Krt20Q9D312 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Krt20Q9D312 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Krt20Q9D312 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Krt20Q9D312 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Krt20Q9D312 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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