Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem53Q9D0Z3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem53Q9D0Z3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem53Q9D0Z3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem53Q9D0Z3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem53Q9D0Z3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem53Q9D0Z3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem53Q9D0Z3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem53Q9D0Z3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem53Q9D0Z3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem53Q9D0Z3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem53Q9D0Z3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem53Q9D0Z3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem53Q9D0Z3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem53Q9D0Z3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms