Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZW6

Rnf146, E3 ubiquitin-protein ligase RNF146, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf146Q9CZW6 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf146Q9CZW6 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf146Q9CZW6 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf146Q9CZW6 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf146Q9CZW6 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf146Q9CZW6 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf146Q9CZW6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf146Q9CZW6 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf146Q9CZW6 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf146Q9CZW6 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf146Q9CZW6 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf146Q9CZW6 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf146Q9CZW6 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf146Q9CZW6 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf146Q9CZW6 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf146Q9CZW6 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf146Q9CZW6 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf146Q9CZW6 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf146Q9CZW6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf146Q9CZW6 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf146Q9CZW6 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf146Q9CZW6 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf146Q9CZW6 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf146Q9CZW6 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf146Q9CZW6 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf146Q9CZW6 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf146Q9CZW6 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf146Q9CZW6 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf146Q9CZW6 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf146Q9CZW6 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf146Q9CZW6 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf146Q9CZW6 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf146Q9CZW6 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf146Q9CZW6 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf146Q9CZW6 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf146Q9CZW6 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf146Q9CZW6 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf146Q9CZW6 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf146Q9CZW6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf146Q9CZW6 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf146Q9CZW6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf146Q9CZW6 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf146Q9CZW6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf146Q9CZW6 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf146Q9CZW6 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf146Q9CZW6 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf146Q9CZW6 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf146Q9CZW6 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf146Q9CZW6 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf146Q9CZW6 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf146Q9CZW6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf146Q9CZW6 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf146Q9CZW6 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf146Q9CZW6 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf146Q9CZW6 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf146Q9CZW6 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf146Q9CZW6 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf146Q9CZW6 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf146Q9CZW6 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf146Q9CZW6 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf146Q9CZW6 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf146Q9CZW6 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf146Q9CZW6 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf146Q9CZW6 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf146Q9CZW6 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf146Q9CZW6 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf146Q9CZW6 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf146Q9CZW6 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf146Q9CZW6 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf146Q9CZW6 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf146Q9CZW6 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf146Q9CZW6 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf146Q9CZW6 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf146Q9CZW6 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf146Q9CZW6 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf146Q9CZW6 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf146Q9CZW6 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf146Q9CZW6 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf146Q9CZW6 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf146Q9CZW6 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf146Q9CZW6 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf146Q9CZW6 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf146Q9CZW6 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf146Q9CZW6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf146Q9CZW6 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf146Q9CZW6 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf146Q9CZW6 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf146Q9CZW6 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf146Q9CZW6 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf146Q9CZW6 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf146Q9CZW6 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf146Q9CZW6 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf146Q9CZW6 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf146Q9CZW6 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf146Q9CZW6 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf146Q9CZW6 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf146Q9CZW6 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf146Q9CZW6 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf146Q9CZW6 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf146Q9CZW6 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms