Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx7Q9CY18 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx7Q9CY18 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx7Q9CY18 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx7Q9CY18 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx7Q9CY18 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx7Q9CY18 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx7Q9CY18 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx7Q9CY18 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx7Q9CY18 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx7Q9CY18 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx7Q9CY18 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx7Q9CY18 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx7Q9CY18 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx7Q9CY18 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx7Q9CY18 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx7Q9CY18 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx7Q9CY18 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx7Q9CY18 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx7Q9CY18 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx7Q9CY18 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx7Q9CY18 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx7Q9CY18 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx7Q9CY18 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx7Q9CY18 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx7Q9CY18 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx7Q9CY18 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx7Q9CY18 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx7Q9CY18 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snx7Q9CY18 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snx7Q9CY18 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snx7Q9CY18 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snx7Q9CY18 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snx7Q9CY18 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snx7Q9CY18 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snx7Q9CY18 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snx7Q9CY18 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Snx7Q9CY18 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snx7Q9CY18 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snx7Q9CY18 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snx7Q9CY18 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snx7Q9CY18 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snx7Q9CY18 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snx7Q9CY18 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snx7Q9CY18 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snx7Q9CY18 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snx7Q9CY18 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snx7Q9CY18 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx7Q9CY18 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx7Q9CY18 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx7Q9CY18 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx7Q9CY18 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx7Q9CY18 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx7Q9CY18 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx7Q9CY18 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx7Q9CY18 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx7Q9CY18 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx7Q9CY18 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx7Q9CY18 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx7Q9CY18 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx7Q9CY18 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx7Q9CY18 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx7Q9CY18 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx7Q9CY18 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx7Q9CY18 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx7Q9CY18 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx7Q9CY18 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx7Q9CY18 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx7Q9CY18 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx7Q9CY18 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx7Q9CY18 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx7Q9CY18 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx7Q9CY18 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx7Q9CY18 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx7Q9CY18 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx7Q9CY18 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx7Q9CY18 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx7Q9CY18 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx7Q9CY18 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx7Q9CY18 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx7Q9CY18 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx7Q9CY18 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx7Q9CY18 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx7Q9CY18 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx7Q9CY18 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx7Q9CY18 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx7Q9CY18 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx7Q9CY18 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx7Q9CY18 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx7Q9CY18 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx7Q9CY18 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx7Q9CY18 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx7Q9CY18 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx7Q9CY18 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx7Q9CY18 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx7Q9CY18 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx7Q9CY18 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx7Q9CY18 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx7Q9CY18 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx7Q9CY18 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms