Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQX4

Pclaf, PCNA-associated factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PclafQ9CQX4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PclafQ9CQX4 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PclafQ9CQX4 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PclafQ9CQX4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PclafQ9CQX4 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PclafQ9CQX4 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PclafQ9CQX4 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PclafQ9CQX4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PclafQ9CQX4 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PclafQ9CQX4 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PclafQ9CQX4 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PclafQ9CQX4 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PclafQ9CQX4 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PclafQ9CQX4 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PclafQ9CQX4 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PclafQ9CQX4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PclafQ9CQX4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PclafQ9CQX4 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PclafQ9CQX4 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PclafQ9CQX4 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PclafQ9CQX4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PclafQ9CQX4 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PclafQ9CQX4 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PclafQ9CQX4 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PclafQ9CQX4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PclafQ9CQX4 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PclafQ9CQX4 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PclafQ9CQX4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PclafQ9CQX4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PclafQ9CQX4 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PclafQ9CQX4 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PclafQ9CQX4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PclafQ9CQX4 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PclafQ9CQX4 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PclafQ9CQX4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PclafQ9CQX4 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PclafQ9CQX4 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PclafQ9CQX4 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PclafQ9CQX4 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PclafQ9CQX4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PclafQ9CQX4 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PclafQ9CQX4 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PclafQ9CQX4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PclafQ9CQX4 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PclafQ9CQX4 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PclafQ9CQX4 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PclafQ9CQX4 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PclafQ9CQX4 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PclafQ9CQX4 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PclafQ9CQX4 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PclafQ9CQX4 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PclafQ9CQX4 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PclafQ9CQX4 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PclafQ9CQX4 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PclafQ9CQX4 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PclafQ9CQX4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PclafQ9CQX4 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PclafQ9CQX4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PclafQ9CQX4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PclafQ9CQX4 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PclafQ9CQX4 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PclafQ9CQX4 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PclafQ9CQX4 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PclafQ9CQX4 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PclafQ9CQX4 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PclafQ9CQX4 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PclafQ9CQX4 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PclafQ9CQX4 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PclafQ9CQX4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PclafQ9CQX4 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PclafQ9CQX4 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PclafQ9CQX4 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PclafQ9CQX4 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PclafQ9CQX4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PclafQ9CQX4 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PclafQ9CQX4 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PclafQ9CQX4 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PclafQ9CQX4 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PclafQ9CQX4 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PclafQ9CQX4 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PclafQ9CQX4 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PclafQ9CQX4 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PclafQ9CQX4 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PclafQ9CQX4 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PclafQ9CQX4 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PclafQ9CQX4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PclafQ9CQX4 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PclafQ9CQX4 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PclafQ9CQX4 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PclafQ9CQX4 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PclafQ9CQX4 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PclafQ9CQX4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PclafQ9CQX4 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PclafQ9CQX4 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PclafQ9CQX4 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PclafQ9CQX4 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PclafQ9CQX4 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PclafQ9CQX4 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PclafQ9CQX4 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PclafQ9CQX4 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms