Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQU3

Rer1, Protein RER1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rer1Q9CQU3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rer1Q9CQU3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rer1Q9CQU3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rer1Q9CQU3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rer1Q9CQU3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rer1Q9CQU3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rer1Q9CQU3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rer1Q9CQU3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rer1Q9CQU3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rer1Q9CQU3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rer1Q9CQU3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rer1Q9CQU3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rer1Q9CQU3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rer1Q9CQU3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rer1Q9CQU3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rer1Q9CQU3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rer1Q9CQU3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rer1Q9CQU3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rer1Q9CQU3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rer1Q9CQU3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rer1Q9CQU3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rer1Q9CQU3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rer1Q9CQU3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rer1Q9CQU3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rer1Q9CQU3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rer1Q9CQU3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rer1Q9CQU3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rer1Q9CQU3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rer1Q9CQU3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rer1Q9CQU3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rer1Q9CQU3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rer1Q9CQU3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rer1Q9CQU3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rer1Q9CQU3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rer1Q9CQU3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rer1Q9CQU3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rer1Q9CQU3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rer1Q9CQU3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rer1Q9CQU3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rer1Q9CQU3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rer1Q9CQU3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rer1Q9CQU3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rer1Q9CQU3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rer1Q9CQU3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rer1Q9CQU3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rer1Q9CQU3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rer1Q9CQU3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rer1Q9CQU3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rer1Q9CQU3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rer1Q9CQU3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rer1Q9CQU3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rer1Q9CQU3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rer1Q9CQU3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rer1Q9CQU3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rer1Q9CQU3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rer1Q9CQU3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rer1Q9CQU3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rer1Q9CQU3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rer1Q9CQU3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rer1Q9CQU3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rer1Q9CQU3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rer1Q9CQU3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rer1Q9CQU3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rer1Q9CQU3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rer1Q9CQU3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rer1Q9CQU3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rer1Q9CQU3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rer1Q9CQU3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rer1Q9CQU3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rer1Q9CQU3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rer1Q9CQU3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rer1Q9CQU3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rer1Q9CQU3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rer1Q9CQU3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rer1Q9CQU3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rer1Q9CQU3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rer1Q9CQU3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rer1Q9CQU3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rer1Q9CQU3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rer1Q9CQU3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rer1Q9CQU3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rer1Q9CQU3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rer1Q9CQU3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rer1Q9CQU3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rer1Q9CQU3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rer1Q9CQU3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rer1Q9CQU3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rer1Q9CQU3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rer1Q9CQU3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rer1Q9CQU3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rer1Q9CQU3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rer1Q9CQU3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rer1Q9CQU3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rer1Q9CQU3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rer1Q9CQU3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rer1Q9CQU3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rer1Q9CQU3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rer1Q9CQU3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rer1Q9CQU3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rer1Q9CQU3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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