Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ26

Stambp, STAM-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StambpQ9CQ26 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
StambpQ9CQ26 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
StambpQ9CQ26 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
StambpQ9CQ26 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
StambpQ9CQ26 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
StambpQ9CQ26 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
StambpQ9CQ26 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
StambpQ9CQ26 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
StambpQ9CQ26 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
StambpQ9CQ26 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
StambpQ9CQ26 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
StambpQ9CQ26 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
StambpQ9CQ26 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
StambpQ9CQ26 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
StambpQ9CQ26 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
StambpQ9CQ26 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
StambpQ9CQ26 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
StambpQ9CQ26 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
StambpQ9CQ26 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
StambpQ9CQ26 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
StambpQ9CQ26 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
StambpQ9CQ26 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
StambpQ9CQ26 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
StambpQ9CQ26 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
StambpQ9CQ26 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
StambpQ9CQ26 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
StambpQ9CQ26 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
StambpQ9CQ26 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
StambpQ9CQ26 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
StambpQ9CQ26 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
StambpQ9CQ26 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
StambpQ9CQ26 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
StambpQ9CQ26 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
StambpQ9CQ26 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
StambpQ9CQ26 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
StambpQ9CQ26 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
StambpQ9CQ26 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
StambpQ9CQ26 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
StambpQ9CQ26 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
StambpQ9CQ26 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
StambpQ9CQ26 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
StambpQ9CQ26 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
StambpQ9CQ26 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
StambpQ9CQ26 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
StambpQ9CQ26 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
StambpQ9CQ26 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
StambpQ9CQ26 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
StambpQ9CQ26 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
StambpQ9CQ26 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
StambpQ9CQ26 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
StambpQ9CQ26 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
StambpQ9CQ26 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
StambpQ9CQ26 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
StambpQ9CQ26 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
StambpQ9CQ26 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
StambpQ9CQ26 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
StambpQ9CQ26 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
StambpQ9CQ26 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
StambpQ9CQ26 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
StambpQ9CQ26 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
StambpQ9CQ26 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
StambpQ9CQ26 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
StambpQ9CQ26 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
StambpQ9CQ26 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
StambpQ9CQ26 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
StambpQ9CQ26 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
StambpQ9CQ26 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
StambpQ9CQ26 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
StambpQ9CQ26 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
StambpQ9CQ26 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
StambpQ9CQ26 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
StambpQ9CQ26 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
StambpQ9CQ26 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
StambpQ9CQ26 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
StambpQ9CQ26 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
StambpQ9CQ26 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
StambpQ9CQ26 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
StambpQ9CQ26 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
StambpQ9CQ26 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
StambpQ9CQ26 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
StambpQ9CQ26 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
StambpQ9CQ26 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
StambpQ9CQ26 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
StambpQ9CQ26 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
StambpQ9CQ26 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
StambpQ9CQ26 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
StambpQ9CQ26 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
StambpQ9CQ26 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
StambpQ9CQ26 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
StambpQ9CQ26 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
StambpQ9CQ26 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
StambpQ9CQ26 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
StambpQ9CQ26 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
StambpQ9CQ26 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
StambpQ9CQ26 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
StambpQ9CQ26 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
StambpQ9CQ26 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
StambpQ9CQ26 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
StambpQ9CQ26 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
StambpQ9CQ26 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms