Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Chmp3Q9CQ10 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chmp3Q9CQ10 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chmp3Q9CQ10 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chmp3Q9CQ10 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chmp3Q9CQ10 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chmp3Q9CQ10 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chmp3Q9CQ10 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chmp3Q9CQ10 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chmp3Q9CQ10 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chmp3Q9CQ10 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chmp3Q9CQ10 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chmp3Q9CQ10 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Chmp3Q9CQ10 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chmp3Q9CQ10 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chmp3Q9CQ10 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chmp3Q9CQ10 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chmp3Q9CQ10 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chmp3Q9CQ10 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chmp3Q9CQ10 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chmp3Q9CQ10 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chmp3Q9CQ10 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Chmp3Q9CQ10 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chmp3Q9CQ10 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chmp3Q9CQ10 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chmp3Q9CQ10 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chmp3Q9CQ10 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chmp3Q9CQ10 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chmp3Q9CQ10 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chmp3Q9CQ10 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chmp3Q9CQ10 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chmp3Q9CQ10 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chmp3Q9CQ10 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chmp3Q9CQ10 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chmp3Q9CQ10 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chmp3Q9CQ10 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chmp3Q9CQ10 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chmp3Q9CQ10 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chmp3Q9CQ10 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chmp3Q9CQ10 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chmp3Q9CQ10 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Chmp3Q9CQ10 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chmp3Q9CQ10 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chmp3Q9CQ10 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chmp3Q9CQ10 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chmp3Q9CQ10 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chmp3Q9CQ10 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chmp3Q9CQ10 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Chmp3Q9CQ10 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Chmp3Q9CQ10 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Chmp3Q9CQ10 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Chmp3Q9CQ10 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Chmp3Q9CQ10 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chmp3Q9CQ10 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chmp3Q9CQ10 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chmp3Q9CQ10 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chmp3Q9CQ10 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chmp3Q9CQ10 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chmp3Q9CQ10 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chmp3Q9CQ10 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chmp3Q9CQ10 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chmp3Q9CQ10 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chmp3Q9CQ10 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chmp3Q9CQ10 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chmp3Q9CQ10 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chmp3Q9CQ10 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chmp3Q9CQ10 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chmp3Q9CQ10 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Chmp3Q9CQ10 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chmp3Q9CQ10 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chmp3Q9CQ10 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chmp3Q9CQ10 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chmp3Q9CQ10 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chmp3Q9CQ10 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Chmp3Q9CQ10 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chmp3Q9CQ10 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chmp3Q9CQ10 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chmp3Q9CQ10 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Chmp3Q9CQ10 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chmp3Q9CQ10 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chmp3Q9CQ10 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chmp3Q9CQ10 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chmp3Q9CQ10 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chmp3Q9CQ10 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Chmp3Q9CQ10 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chmp3Q9CQ10 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chmp3Q9CQ10 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chmp3Q9CQ10 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chmp3Q9CQ10 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chmp3Q9CQ10 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chmp3Q9CQ10 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chmp3Q9CQ10 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chmp3Q9CQ10 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Chmp3Q9CQ10 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chmp3Q9CQ10 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chmp3Q9CQ10 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chmp3Q9CQ10 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chmp3Q9CQ10 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chmp3Q9CQ10 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chmp3Q9CQ10 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
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