Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Commd4Q9CQ02 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms