Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nlgn1Q99K10 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nlgn1Q99K10 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Nlgn1Q99K10 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nlgn1Q99K10 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nlgn1Q99K10 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nlgn1Q99K10 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Nlgn1Q99K10 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nlgn1Q99K10 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nlgn1Q99K10 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nlgn1Q99K10 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nlgn1Q99K10 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nlgn1Q99K10 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nlgn1Q99K10 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nlgn1Q99K10 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nlgn1Q99K10 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nlgn1Q99K10 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nlgn1Q99K10 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nlgn1Q99K10 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nlgn1Q99K10 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Nlgn1Q99K10 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nlgn1Q99K10 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nlgn1Q99K10 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nlgn1Q99K10 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nlgn1Q99K10 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nlgn1Q99K10 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nlgn1Q99K10 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nlgn1Q99K10 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nlgn1Q99K10 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nlgn1Q99K10 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nlgn1Q99K10 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nlgn1Q99K10 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nlgn1Q99K10 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nlgn1Q99K10 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nlgn1Q99K10 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nlgn1Q99K10 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nlgn1Q99K10 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nlgn1Q99K10 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nlgn1Q99K10 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nlgn1Q99K10 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nlgn1Q99K10 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nlgn1Q99K10 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nlgn1Q99K10 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nlgn1Q99K10 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nlgn1Q99K10 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nlgn1Q99K10 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nlgn1Q99K10 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nlgn1Q99K10 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nlgn1Q99K10 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nlgn1Q99K10 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nlgn1Q99K10 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nlgn1Q99K10 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nlgn1Q99K10 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nlgn1Q99K10 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nlgn1Q99K10 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nlgn1Q99K10 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nlgn1Q99K10 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nlgn1Q99K10 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nlgn1Q99K10 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nlgn1Q99K10 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nlgn1Q99K10 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nlgn1Q99K10 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nlgn1Q99K10 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nlgn1Q99K10 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nlgn1Q99K10 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nlgn1Q99K10 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nlgn1Q99K10 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Nlgn1Q99K10 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nlgn1Q99K10 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Nlgn1Q99K10 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nlgn1Q99K10 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nlgn1Q99K10 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nlgn1Q99K10 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nlgn1Q99K10 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nlgn1Q99K10 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nlgn1Q99K10 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nlgn1Q99K10 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Nlgn1Q99K10 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nlgn1Q99K10 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nlgn1Q99K10 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nlgn1Q99K10 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nlgn1Q99K10 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nlgn1Q99K10 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nlgn1Q99K10 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nlgn1Q99K10 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nlgn1Q99K10 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nlgn1Q99K10 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nlgn1Q99K10 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nlgn1Q99K10 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nlgn1Q99K10 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nlgn1Q99K10 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nlgn1Q99K10 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nlgn1Q99K10 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nlgn1Q99K10 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nlgn1Q99K10 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nlgn1Q99K10 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nlgn1Q99K10 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nlgn1Q99K10 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nlgn1Q99K10 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nlgn1Q99K10 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms