Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TrabdQ99JY4 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TrabdQ99JY4 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TrabdQ99JY4 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TrabdQ99JY4 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TrabdQ99JY4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TrabdQ99JY4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TrabdQ99JY4 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TrabdQ99JY4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TrabdQ99JY4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TrabdQ99JY4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TrabdQ99JY4 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TrabdQ99JY4 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TrabdQ99JY4 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TrabdQ99JY4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TrabdQ99JY4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TrabdQ99JY4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TrabdQ99JY4 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TrabdQ99JY4 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TrabdQ99JY4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TrabdQ99JY4 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TrabdQ99JY4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TrabdQ99JY4 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TrabdQ99JY4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TrabdQ99JY4 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TrabdQ99JY4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TrabdQ99JY4 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TrabdQ99JY4 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TrabdQ99JY4 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TrabdQ99JY4 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TrabdQ99JY4 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TrabdQ99JY4 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TrabdQ99JY4 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TrabdQ99JY4 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TrabdQ99JY4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TrabdQ99JY4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TrabdQ99JY4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TrabdQ99JY4 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TrabdQ99JY4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TrabdQ99JY4 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TrabdQ99JY4 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TrabdQ99JY4 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TrabdQ99JY4 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TrabdQ99JY4 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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TrabdQ99JY4 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TrabdQ99JY4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TrabdQ99JY4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TrabdQ99JY4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
TrabdQ99JY4 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TrabdQ99JY4 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TrabdQ99JY4 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TrabdQ99JY4 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TrabdQ99JY4 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
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TrabdQ99JY4 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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TrabdQ99JY4 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TrabdQ99JY4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TrabdQ99JY4 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TrabdQ99JY4 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TrabdQ99JY4 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TrabdQ99JY4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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TrabdQ99JY4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TrabdQ99JY4 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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TrabdQ99JY4 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TrabdQ99JY4 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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TrabdQ99JY4 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TrabdQ99JY4 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TrabdQ99JY4 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TrabdQ99JY4 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TrabdQ99JY4 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TrabdQ99JY4 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TrabdQ99JY4 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TrabdQ99JY4 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
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TrabdQ99JY4 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TrabdQ99JY4 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TrabdQ99JY4 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TrabdQ99JY4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TrabdQ99JY4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TrabdQ99JY4 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TrabdQ99JY4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TrabdQ99JY4 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TrabdQ99JY4 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TrabdQ99JY4 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TrabdQ99JY4 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TrabdQ99JY4 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TrabdQ99JY4 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TrabdQ99JY4 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TrabdQ99JY4 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TrabdQ99JY4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TrabdQ99JY4 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TrabdQ99JY4 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TrabdQ99JY4 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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