Protein–RNA interactions for Protein: Q99J31

Ophn1, Oligophrenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ophn1Q99J31 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ophn1Q99J31 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ophn1Q99J31 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ophn1Q99J31 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ophn1Q99J31 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ophn1Q99J31 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ophn1Q99J31 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ophn1Q99J31 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ophn1Q99J31 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ophn1Q99J31 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ophn1Q99J31 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ophn1Q99J31 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ophn1Q99J31 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ophn1Q99J31 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ophn1Q99J31 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ophn1Q99J31 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ophn1Q99J31 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ophn1Q99J31 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ophn1Q99J31 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ophn1Q99J31 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ophn1Q99J31 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ophn1Q99J31 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ophn1Q99J31 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ophn1Q99J31 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ophn1Q99J31 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ophn1Q99J31 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ophn1Q99J31 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ophn1Q99J31 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ophn1Q99J31 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ophn1Q99J31 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ophn1Q99J31 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ophn1Q99J31 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ophn1Q99J31 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ophn1Q99J31 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ophn1Q99J31 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ophn1Q99J31 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ophn1Q99J31 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ophn1Q99J31 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ophn1Q99J31 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ophn1Q99J31 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ophn1Q99J31 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ophn1Q99J31 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ophn1Q99J31 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ophn1Q99J31 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ophn1Q99J31 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ophn1Q99J31 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ophn1Q99J31 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ophn1Q99J31 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ophn1Q99J31 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ophn1Q99J31 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ophn1Q99J31 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ophn1Q99J31 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ophn1Q99J31 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ophn1Q99J31 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ophn1Q99J31 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ophn1Q99J31 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ophn1Q99J31 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ophn1Q99J31 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ophn1Q99J31 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ophn1Q99J31 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ophn1Q99J31 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ophn1Q99J31 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ophn1Q99J31 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ophn1Q99J31 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ophn1Q99J31 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ophn1Q99J31 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ophn1Q99J31 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ophn1Q99J31 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ophn1Q99J31 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ophn1Q99J31 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ophn1Q99J31 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ophn1Q99J31 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ophn1Q99J31 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ophn1Q99J31 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ophn1Q99J31 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ophn1Q99J31 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ophn1Q99J31 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ophn1Q99J31 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ophn1Q99J31 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ophn1Q99J31 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ophn1Q99J31 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ophn1Q99J31 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ophn1Q99J31 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ophn1Q99J31 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ophn1Q99J31 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ophn1Q99J31 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ophn1Q99J31 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ophn1Q99J31 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ophn1Q99J31 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ophn1Q99J31 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ophn1Q99J31 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ophn1Q99J31 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ophn1Q99J31 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ophn1Q99J31 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ophn1Q99J31 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ophn1Q99J31 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ophn1Q99J31 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ophn1Q99J31 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ophn1Q99J31 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ophn1Q99J31 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms