Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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