Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE42

Ankrd49, Ankyrin repeat domain-containing protein 49, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd49Q8VE42 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ankrd49Q8VE42 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ankrd49Q8VE42 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ankrd49Q8VE42 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ankrd49Q8VE42 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ankrd49Q8VE42 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ankrd49Q8VE42 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ankrd49Q8VE42 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ankrd49Q8VE42 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ankrd49Q8VE42 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ankrd49Q8VE42 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ankrd49Q8VE42 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ankrd49Q8VE42 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ankrd49Q8VE42 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ankrd49Q8VE42 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ankrd49Q8VE42 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ankrd49Q8VE42 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ankrd49Q8VE42 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ankrd49Q8VE42 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ankrd49Q8VE42 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ankrd49Q8VE42 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ankrd49Q8VE42 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ankrd49Q8VE42 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ankrd49Q8VE42 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ankrd49Q8VE42 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ankrd49Q8VE42 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ankrd49Q8VE42 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ankrd49Q8VE42 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ankrd49Q8VE42 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ankrd49Q8VE42 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ankrd49Q8VE42 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ankrd49Q8VE42 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ankrd49Q8VE42 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ankrd49Q8VE42 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ankrd49Q8VE42 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ankrd49Q8VE42 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ankrd49Q8VE42 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ankrd49Q8VE42 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ankrd49Q8VE42 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ankrd49Q8VE42 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ankrd49Q8VE42 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ankrd49Q8VE42 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ankrd49Q8VE42 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ankrd49Q8VE42 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ankrd49Q8VE42 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ankrd49Q8VE42 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ankrd49Q8VE42 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ankrd49Q8VE42 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ankrd49Q8VE42 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ankrd49Q8VE42 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ankrd49Q8VE42 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ankrd49Q8VE42 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ankrd49Q8VE42 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ankrd49Q8VE42 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ankrd49Q8VE42 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ankrd49Q8VE42 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ankrd49Q8VE42 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ankrd49Q8VE42 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ankrd49Q8VE42 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ankrd49Q8VE42 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ankrd49Q8VE42 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ankrd49Q8VE42 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ankrd49Q8VE42 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ankrd49Q8VE42 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ankrd49Q8VE42 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ankrd49Q8VE42 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ankrd49Q8VE42 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ankrd49Q8VE42 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ankrd49Q8VE42 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms