Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3W2

0610009B22Rik, MCG6979, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
0610009B22RikQ8R3W2 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
0610009B22RikQ8R3W2 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
0610009B22RikQ8R3W2 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
0610009B22RikQ8R3W2 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
0610009B22RikQ8R3W2 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
0610009B22RikQ8R3W2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
0610009B22RikQ8R3W2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
0610009B22RikQ8R3W2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
0610009B22RikQ8R3W2 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
0610009B22RikQ8R3W2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
0610009B22RikQ8R3W2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
0610009B22RikQ8R3W2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
0610009B22RikQ8R3W2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
0610009B22RikQ8R3W2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
0610009B22RikQ8R3W2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
0610009B22RikQ8R3W2 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
0610009B22RikQ8R3W2 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
0610009B22RikQ8R3W2 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
0610009B22RikQ8R3W2 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
0610009B22RikQ8R3W2 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
0610009B22RikQ8R3W2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
0610009B22RikQ8R3W2 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
0610009B22RikQ8R3W2 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
0610009B22RikQ8R3W2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
0610009B22RikQ8R3W2 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
0610009B22RikQ8R3W2 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
0610009B22RikQ8R3W2 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
0610009B22RikQ8R3W2 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
0610009B22RikQ8R3W2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
0610009B22RikQ8R3W2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
0610009B22RikQ8R3W2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
0610009B22RikQ8R3W2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
0610009B22RikQ8R3W2 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
0610009B22RikQ8R3W2 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
0610009B22RikQ8R3W2 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
0610009B22RikQ8R3W2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
0610009B22RikQ8R3W2 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
0610009B22RikQ8R3W2 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
0610009B22RikQ8R3W2 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
0610009B22RikQ8R3W2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
0610009B22RikQ8R3W2 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
0610009B22RikQ8R3W2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
0610009B22RikQ8R3W2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
0610009B22RikQ8R3W2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
0610009B22RikQ8R3W2 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
0610009B22RikQ8R3W2 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
0610009B22RikQ8R3W2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
0610009B22RikQ8R3W2 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
0610009B22RikQ8R3W2 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
0610009B22RikQ8R3W2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
0610009B22RikQ8R3W2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
0610009B22RikQ8R3W2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
0610009B22RikQ8R3W2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
0610009B22RikQ8R3W2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
0610009B22RikQ8R3W2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
0610009B22RikQ8R3W2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
0610009B22RikQ8R3W2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
0610009B22RikQ8R3W2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
0610009B22RikQ8R3W2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
0610009B22RikQ8R3W2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
0610009B22RikQ8R3W2 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
0610009B22RikQ8R3W2 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
0610009B22RikQ8R3W2 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
0610009B22RikQ8R3W2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
0610009B22RikQ8R3W2 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
0610009B22RikQ8R3W2 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
0610009B22RikQ8R3W2 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
0610009B22RikQ8R3W2 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
0610009B22RikQ8R3W2 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
0610009B22RikQ8R3W2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
0610009B22RikQ8R3W2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
0610009B22RikQ8R3W2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
0610009B22RikQ8R3W2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
0610009B22RikQ8R3W2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
0610009B22RikQ8R3W2 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
0610009B22RikQ8R3W2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
0610009B22RikQ8R3W2 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
0610009B22RikQ8R3W2 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
0610009B22RikQ8R3W2 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
0610009B22RikQ8R3W2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
0610009B22RikQ8R3W2 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
0610009B22RikQ8R3W2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
0610009B22RikQ8R3W2 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
0610009B22RikQ8R3W2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
0610009B22RikQ8R3W2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
0610009B22RikQ8R3W2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
0610009B22RikQ8R3W2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
0610009B22RikQ8R3W2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
0610009B22RikQ8R3W2 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
0610009B22RikQ8R3W2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
0610009B22RikQ8R3W2 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
0610009B22RikQ8R3W2 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
0610009B22RikQ8R3W2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
0610009B22RikQ8R3W2 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
0610009B22RikQ8R3W2 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
0610009B22RikQ8R3W2 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
0610009B22RikQ8R3W2 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
0610009B22RikQ8R3W2 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
0610009B22RikQ8R3W2 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
0610009B22RikQ8R3W2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms