Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2X2

Rbm48, RNA-binding protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm48Q8K2X2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbm48Q8K2X2 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbm48Q8K2X2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbm48Q8K2X2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbm48Q8K2X2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rbm48Q8K2X2 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbm48Q8K2X2 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbm48Q8K2X2 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbm48Q8K2X2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbm48Q8K2X2 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbm48Q8K2X2 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbm48Q8K2X2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rbm48Q8K2X2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbm48Q8K2X2 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbm48Q8K2X2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbm48Q8K2X2 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbm48Q8K2X2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbm48Q8K2X2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbm48Q8K2X2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rbm48Q8K2X2 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbm48Q8K2X2 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbm48Q8K2X2 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbm48Q8K2X2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbm48Q8K2X2 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbm48Q8K2X2 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbm48Q8K2X2 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rbm48Q8K2X2 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbm48Q8K2X2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbm48Q8K2X2 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbm48Q8K2X2 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbm48Q8K2X2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbm48Q8K2X2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rbm48Q8K2X2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbm48Q8K2X2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rbm48Q8K2X2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rbm48Q8K2X2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Rbm48Q8K2X2 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbm48Q8K2X2 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbm48Q8K2X2 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbm48Q8K2X2 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbm48Q8K2X2 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rbm48Q8K2X2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbm48Q8K2X2 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rbm48Q8K2X2 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbm48Q8K2X2 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbm48Q8K2X2 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbm48Q8K2X2 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbm48Q8K2X2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rbm48Q8K2X2 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rbm48Q8K2X2 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rbm48Q8K2X2 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rbm48Q8K2X2 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rbm48Q8K2X2 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rbm48Q8K2X2 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rbm48Q8K2X2 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rbm48Q8K2X2 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rbm48Q8K2X2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rbm48Q8K2X2 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rbm48Q8K2X2 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rbm48Q8K2X2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rbm48Q8K2X2 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rbm48Q8K2X2 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rbm48Q8K2X2 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rbm48Q8K2X2 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Rbm48Q8K2X2 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rbm48Q8K2X2 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rbm48Q8K2X2 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rbm48Q8K2X2 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rbm48Q8K2X2 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbm48Q8K2X2 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbm48Q8K2X2 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbm48Q8K2X2 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbm48Q8K2X2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbm48Q8K2X2 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbm48Q8K2X2 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbm48Q8K2X2 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbm48Q8K2X2 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbm48Q8K2X2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbm48Q8K2X2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rbm48Q8K2X2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rbm48Q8K2X2 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbm48Q8K2X2 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbm48Q8K2X2 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbm48Q8K2X2 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbm48Q8K2X2 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbm48Q8K2X2 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbm48Q8K2X2 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rbm48Q8K2X2 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbm48Q8K2X2 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rbm48Q8K2X2 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbm48Q8K2X2 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rbm48Q8K2X2 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbm48Q8K2X2 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbm48Q8K2X2 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rbm48Q8K2X2 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rbm48Q8K2X2 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbm48Q8K2X2 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbm48Q8K2X2 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbm48Q8K2X2 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbm48Q8K2X2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms