Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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Usp27Q8CEG8 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp27Q8CEG8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp27Q8CEG8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp27Q8CEG8 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp27Q8CEG8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp27Q8CEG8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp27Q8CEG8 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp27Q8CEG8 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp27Q8CEG8 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp27Q8CEG8 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp27Q8CEG8 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp27Q8CEG8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp27Q8CEG8 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp27Q8CEG8 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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Usp27Q8CEG8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
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Usp27Q8CEG8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
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Usp27Q8CEG8 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp27Q8CEG8 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp27Q8CEG8 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp27Q8CEG8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp27Q8CEG8 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp27Q8CEG8 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp27Q8CEG8 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp27Q8CEG8 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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Usp27Q8CEG8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp27Q8CEG8 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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Usp27Q8CEG8 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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Usp27Q8CEG8 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
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Usp27Q8CEG8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp27Q8CEG8 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp27Q8CEG8 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
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Usp27Q8CEG8 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp27Q8CEG8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp27Q8CEG8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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Usp27Q8CEG8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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Usp27Q8CEG8 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp27Q8CEG8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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Usp27Q8CEG8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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Usp27Q8CEG8 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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Usp27Q8CEG8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp27Q8CEG8 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp27Q8CEG8 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp27Q8CEG8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp27Q8CEG8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp27Q8CEG8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp27Q8CEG8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp27Q8CEG8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp27Q8CEG8 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp27Q8CEG8 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp27Q8CEG8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp27Q8CEG8 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
Usp27Q8CEG8 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Usp27Q8CEG8 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Usp27Q8CEG8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Usp27Q8CEG8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Usp27Q8CEG8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Usp27Q8CEG8 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Usp27Q8CEG8 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
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Usp27Q8CEG8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp27Q8CEG8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp27Q8CEG8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp27Q8CEG8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp27Q8CEG8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp27Q8CEG8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp27Q8CEG8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms