Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc87Q8CDL9 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc87Q8CDL9 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc87Q8CDL9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc87Q8CDL9 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc87Q8CDL9 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc87Q8CDL9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc87Q8CDL9 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc87Q8CDL9 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc87Q8CDL9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc87Q8CDL9 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc87Q8CDL9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc87Q8CDL9 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc87Q8CDL9 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc87Q8CDL9 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc87Q8CDL9 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc87Q8CDL9 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc87Q8CDL9 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc87Q8CDL9 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc87Q8CDL9 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc87Q8CDL9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc87Q8CDL9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc87Q8CDL9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc87Q8CDL9 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc87Q8CDL9 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc87Q8CDL9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc87Q8CDL9 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc87Q8CDL9 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc87Q8CDL9 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc87Q8CDL9 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc87Q8CDL9 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc87Q8CDL9 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc87Q8CDL9 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc87Q8CDL9 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc87Q8CDL9 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc87Q8CDL9 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc87Q8CDL9 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc87Q8CDL9 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc87Q8CDL9 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc87Q8CDL9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc87Q8CDL9 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc87Q8CDL9 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc87Q8CDL9 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc87Q8CDL9 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc87Q8CDL9 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc87Q8CDL9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc87Q8CDL9 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc87Q8CDL9 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc87Q8CDL9 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc87Q8CDL9 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc87Q8CDL9 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc87Q8CDL9 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc87Q8CDL9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc87Q8CDL9 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc87Q8CDL9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc87Q8CDL9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc87Q8CDL9 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc87Q8CDL9 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc87Q8CDL9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc87Q8CDL9 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc87Q8CDL9 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc87Q8CDL9 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc87Q8CDL9 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc87Q8CDL9 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc87Q8CDL9 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc87Q8CDL9 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc87Q8CDL9 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc87Q8CDL9 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc87Q8CDL9 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc87Q8CDL9 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc87Q8CDL9 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc87Q8CDL9 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc87Q8CDL9 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc87Q8CDL9 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc87Q8CDL9 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc87Q8CDL9 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc87Q8CDL9 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc87Q8CDL9 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc87Q8CDL9 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc87Q8CDL9 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc87Q8CDL9 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc87Q8CDL9 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc87Q8CDL9 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc87Q8CDL9 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc87Q8CDL9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc87Q8CDL9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc87Q8CDL9 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc87Q8CDL9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc87Q8CDL9 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc87Q8CDL9 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc87Q8CDL9 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc87Q8CDL9 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc87Q8CDL9 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc87Q8CDL9 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc87Q8CDL9 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc87Q8CDL9 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc87Q8CDL9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc87Q8CDL9 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc87Q8CDL9 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc87Q8CDL9 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms