Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCI5

Rybp, RING1 and YY1-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RybpQ8CCI5 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RybpQ8CCI5 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RybpQ8CCI5 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RybpQ8CCI5 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RybpQ8CCI5 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RybpQ8CCI5 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RybpQ8CCI5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RybpQ8CCI5 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RybpQ8CCI5 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RybpQ8CCI5 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RybpQ8CCI5 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RybpQ8CCI5 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RybpQ8CCI5 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RybpQ8CCI5 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RybpQ8CCI5 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RybpQ8CCI5 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RybpQ8CCI5 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RybpQ8CCI5 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RybpQ8CCI5 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RybpQ8CCI5 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RybpQ8CCI5 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RybpQ8CCI5 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RybpQ8CCI5 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RybpQ8CCI5 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RybpQ8CCI5 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RybpQ8CCI5 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RybpQ8CCI5 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RybpQ8CCI5 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RybpQ8CCI5 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RybpQ8CCI5 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RybpQ8CCI5 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RybpQ8CCI5 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RybpQ8CCI5 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RybpQ8CCI5 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RybpQ8CCI5 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RybpQ8CCI5 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RybpQ8CCI5 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RybpQ8CCI5 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RybpQ8CCI5 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RybpQ8CCI5 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RybpQ8CCI5 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RybpQ8CCI5 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RybpQ8CCI5 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RybpQ8CCI5 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RybpQ8CCI5 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RybpQ8CCI5 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RybpQ8CCI5 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RybpQ8CCI5 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RybpQ8CCI5 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RybpQ8CCI5 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RybpQ8CCI5 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RybpQ8CCI5 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RybpQ8CCI5 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RybpQ8CCI5 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RybpQ8CCI5 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RybpQ8CCI5 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RybpQ8CCI5 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RybpQ8CCI5 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RybpQ8CCI5 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RybpQ8CCI5 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RybpQ8CCI5 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RybpQ8CCI5 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RybpQ8CCI5 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RybpQ8CCI5 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RybpQ8CCI5 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RybpQ8CCI5 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RybpQ8CCI5 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RybpQ8CCI5 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RybpQ8CCI5 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RybpQ8CCI5 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RybpQ8CCI5 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RybpQ8CCI5 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RybpQ8CCI5 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RybpQ8CCI5 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RybpQ8CCI5 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RybpQ8CCI5 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RybpQ8CCI5 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RybpQ8CCI5 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RybpQ8CCI5 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RybpQ8CCI5 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RybpQ8CCI5 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RybpQ8CCI5 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RybpQ8CCI5 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RybpQ8CCI5 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RybpQ8CCI5 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RybpQ8CCI5 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RybpQ8CCI5 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RybpQ8CCI5 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RybpQ8CCI5 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RybpQ8CCI5 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RybpQ8CCI5 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RybpQ8CCI5 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RybpQ8CCI5 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RybpQ8CCI5 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RybpQ8CCI5 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RybpQ8CCI5 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RybpQ8CCI5 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RybpQ8CCI5 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RybpQ8CCI5 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RybpQ8CCI5 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms