Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6A8

Bhlhe22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe22Q8C6A8 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bhlhe22Q8C6A8 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bhlhe22Q8C6A8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bhlhe22Q8C6A8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bhlhe22Q8C6A8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bhlhe22Q8C6A8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bhlhe22Q8C6A8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bhlhe22Q8C6A8 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bhlhe22Q8C6A8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms