Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3X2

Ccdc90b, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc90bQ8C3X2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc90bQ8C3X2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc90bQ8C3X2 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc90bQ8C3X2 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc90bQ8C3X2 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc90bQ8C3X2 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc90bQ8C3X2 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc90bQ8C3X2 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc90bQ8C3X2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc90bQ8C3X2 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc90bQ8C3X2 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc90bQ8C3X2 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ccdc90bQ8C3X2 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ccdc90bQ8C3X2 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ccdc90bQ8C3X2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ccdc90bQ8C3X2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ccdc90bQ8C3X2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc90bQ8C3X2 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc90bQ8C3X2 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc90bQ8C3X2 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc90bQ8C3X2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc90bQ8C3X2 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc90bQ8C3X2 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc90bQ8C3X2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc90bQ8C3X2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc90bQ8C3X2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc90bQ8C3X2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc90bQ8C3X2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc90bQ8C3X2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc90bQ8C3X2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc90bQ8C3X2 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc90bQ8C3X2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc90bQ8C3X2 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc90bQ8C3X2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc90bQ8C3X2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc90bQ8C3X2 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc90bQ8C3X2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc90bQ8C3X2 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc90bQ8C3X2 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc90bQ8C3X2 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc90bQ8C3X2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc90bQ8C3X2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc90bQ8C3X2 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc90bQ8C3X2 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc90bQ8C3X2 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc90bQ8C3X2 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc90bQ8C3X2 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc90bQ8C3X2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc90bQ8C3X2 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc90bQ8C3X2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc90bQ8C3X2 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc90bQ8C3X2 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc90bQ8C3X2 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc90bQ8C3X2 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc90bQ8C3X2 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc90bQ8C3X2 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc90bQ8C3X2 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc90bQ8C3X2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc90bQ8C3X2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc90bQ8C3X2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc90bQ8C3X2 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc90bQ8C3X2 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc90bQ8C3X2 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc90bQ8C3X2 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc90bQ8C3X2 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc90bQ8C3X2 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc90bQ8C3X2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc90bQ8C3X2 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc90bQ8C3X2 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc90bQ8C3X2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc90bQ8C3X2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc90bQ8C3X2 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc90bQ8C3X2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc90bQ8C3X2 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc90bQ8C3X2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc90bQ8C3X2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc90bQ8C3X2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc90bQ8C3X2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc90bQ8C3X2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc90bQ8C3X2 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc90bQ8C3X2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc90bQ8C3X2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc90bQ8C3X2 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc90bQ8C3X2 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc90bQ8C3X2 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc90bQ8C3X2 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc90bQ8C3X2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc90bQ8C3X2 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc90bQ8C3X2 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc90bQ8C3X2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc90bQ8C3X2 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc90bQ8C3X2 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc90bQ8C3X2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc90bQ8C3X2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc90bQ8C3X2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc90bQ8C3X2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc90bQ8C3X2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc90bQ8C3X2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc90bQ8C3X2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc90bQ8C3X2 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms