Protein–RNA interactions for Protein: Q8C262

Irgc, Interferon-inducible GTPase 5, mousemouse

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IrgcQ8C262 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IrgcQ8C262 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IrgcQ8C262 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IrgcQ8C262 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IrgcQ8C262 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16■□□□□ 0.15
IrgcQ8C262 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IrgcQ8C262 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IrgcQ8C262 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IrgcQ8C262 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IrgcQ8C262 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IrgcQ8C262 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IrgcQ8C262 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IrgcQ8C262 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IrgcQ8C262 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
IrgcQ8C262 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IrgcQ8C262 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IrgcQ8C262 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IrgcQ8C262 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IrgcQ8C262 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IrgcQ8C262 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IrgcQ8C262 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IrgcQ8C262 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IrgcQ8C262 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IrgcQ8C262 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IrgcQ8C262 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IrgcQ8C262 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IrgcQ8C262 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IrgcQ8C262 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IrgcQ8C262 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IrgcQ8C262 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IrgcQ8C262 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IrgcQ8C262 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IrgcQ8C262 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IrgcQ8C262 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IrgcQ8C262 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IrgcQ8C262 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IrgcQ8C262 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IrgcQ8C262 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IrgcQ8C262 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IrgcQ8C262 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IrgcQ8C262 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IrgcQ8C262 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IrgcQ8C262 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IrgcQ8C262 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IrgcQ8C262 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IrgcQ8C262 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IrgcQ8C262 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IrgcQ8C262 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IrgcQ8C262 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IrgcQ8C262 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IrgcQ8C262 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IrgcQ8C262 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IrgcQ8C262 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IrgcQ8C262 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IrgcQ8C262 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IrgcQ8C262 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IrgcQ8C262 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IrgcQ8C262 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IrgcQ8C262 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IrgcQ8C262 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IrgcQ8C262 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IrgcQ8C262 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IrgcQ8C262 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IrgcQ8C262 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IrgcQ8C262 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IrgcQ8C262 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IrgcQ8C262 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IrgcQ8C262 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IrgcQ8C262 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IrgcQ8C262 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IrgcQ8C262 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IrgcQ8C262 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IrgcQ8C262 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IrgcQ8C262 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IrgcQ8C262 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IrgcQ8C262 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IrgcQ8C262 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IrgcQ8C262 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IrgcQ8C262 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IrgcQ8C262 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IrgcQ8C262 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IrgcQ8C262 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IrgcQ8C262 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IrgcQ8C262 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IrgcQ8C262 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IrgcQ8C262 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IrgcQ8C262 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IrgcQ8C262 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IrgcQ8C262 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IrgcQ8C262 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IrgcQ8C262 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IrgcQ8C262 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IrgcQ8C262 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IrgcQ8C262 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IrgcQ8C262 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IrgcQ8C262 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IrgcQ8C262 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IrgcQ8C262 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IrgcQ8C262 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IrgcQ8C262 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms