Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg16l1Q8C0J2 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg16l1Q8C0J2 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg16l1Q8C0J2 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg16l1Q8C0J2 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg16l1Q8C0J2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg16l1Q8C0J2 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg16l1Q8C0J2 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg16l1Q8C0J2 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg16l1Q8C0J2 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg16l1Q8C0J2 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg16l1Q8C0J2 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg16l1Q8C0J2 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg16l1Q8C0J2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg16l1Q8C0J2 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg16l1Q8C0J2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg16l1Q8C0J2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg16l1Q8C0J2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg16l1Q8C0J2 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg16l1Q8C0J2 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg16l1Q8C0J2 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg16l1Q8C0J2 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg16l1Q8C0J2 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg16l1Q8C0J2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg16l1Q8C0J2 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg16l1Q8C0J2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg16l1Q8C0J2 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg16l1Q8C0J2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg16l1Q8C0J2 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg16l1Q8C0J2 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg16l1Q8C0J2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg16l1Q8C0J2 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg16l1Q8C0J2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg16l1Q8C0J2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg16l1Q8C0J2 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg16l1Q8C0J2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg16l1Q8C0J2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg16l1Q8C0J2 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg16l1Q8C0J2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg16l1Q8C0J2 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg16l1Q8C0J2 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg16l1Q8C0J2 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg16l1Q8C0J2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg16l1Q8C0J2 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg16l1Q8C0J2 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms