Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVN3

Catsper4, Cation channel sperm-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Catsper4Q8BVN3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Catsper4Q8BVN3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Catsper4Q8BVN3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Catsper4Q8BVN3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Catsper4Q8BVN3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Catsper4Q8BVN3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Catsper4Q8BVN3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Catsper4Q8BVN3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Catsper4Q8BVN3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Catsper4Q8BVN3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Catsper4Q8BVN3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Catsper4Q8BVN3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Catsper4Q8BVN3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Catsper4Q8BVN3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Catsper4Q8BVN3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Catsper4Q8BVN3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Catsper4Q8BVN3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Catsper4Q8BVN3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Catsper4Q8BVN3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Catsper4Q8BVN3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Catsper4Q8BVN3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Catsper4Q8BVN3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Catsper4Q8BVN3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Catsper4Q8BVN3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Catsper4Q8BVN3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Catsper4Q8BVN3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Catsper4Q8BVN3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Catsper4Q8BVN3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Catsper4Q8BVN3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Catsper4Q8BVN3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Catsper4Q8BVN3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Catsper4Q8BVN3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Catsper4Q8BVN3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Catsper4Q8BVN3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Catsper4Q8BVN3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Catsper4Q8BVN3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Catsper4Q8BVN3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Catsper4Q8BVN3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Catsper4Q8BVN3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Catsper4Q8BVN3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Catsper4Q8BVN3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Catsper4Q8BVN3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Catsper4Q8BVN3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Catsper4Q8BVN3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms