Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGW3

Bhlhe23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe23Q8BGW3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bhlhe23Q8BGW3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Bhlhe23Q8BGW3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bhlhe23Q8BGW3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bhlhe23Q8BGW3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Bhlhe23Q8BGW3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bhlhe23Q8BGW3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bhlhe23Q8BGW3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bhlhe23Q8BGW3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bhlhe23Q8BGW3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bhlhe23Q8BGW3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bhlhe23Q8BGW3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bhlhe23Q8BGW3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bhlhe23Q8BGW3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bhlhe23Q8BGW3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bhlhe23Q8BGW3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bhlhe23Q8BGW3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bhlhe23Q8BGW3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlhe23Q8BGW3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlhe23Q8BGW3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlhe23Q8BGW3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlhe23Q8BGW3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlhe23Q8BGW3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlhe23Q8BGW3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlhe23Q8BGW3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlhe23Q8BGW3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlhe23Q8BGW3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlhe23Q8BGW3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlhe23Q8BGW3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlhe23Q8BGW3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlhe23Q8BGW3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlhe23Q8BGW3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlhe23Q8BGW3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlhe23Q8BGW3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlhe23Q8BGW3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhe23Q8BGW3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhe23Q8BGW3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhe23Q8BGW3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhe23Q8BGW3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhe23Q8BGW3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhe23Q8BGW3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhe23Q8BGW3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhe23Q8BGW3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhe23Q8BGW3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhe23Q8BGW3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhe23Q8BGW3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhe23Q8BGW3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhe23Q8BGW3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhe23Q8BGW3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhe23Q8BGW3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhe23Q8BGW3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhe23Q8BGW3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhe23Q8BGW3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhe23Q8BGW3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhe23Q8BGW3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhe23Q8BGW3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bhlhe23Q8BGW3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bhlhe23Q8BGW3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bhlhe23Q8BGW3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bhlhe23Q8BGW3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bhlhe23Q8BGW3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bhlhe23Q8BGW3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bhlhe23Q8BGW3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bhlhe23Q8BGW3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bhlhe23Q8BGW3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bhlhe23Q8BGW3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bhlhe23Q8BGW3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bhlhe23Q8BGW3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bhlhe23Q8BGW3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bhlhe23Q8BGW3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bhlhe23Q8BGW3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bhlhe23Q8BGW3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bhlhe23Q8BGW3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bhlhe23Q8BGW3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bhlhe23Q8BGW3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bhlhe23Q8BGW3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bhlhe23Q8BGW3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bhlhe23Q8BGW3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Bhlhe23Q8BGW3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bhlhe23Q8BGW3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms