Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChfrQ810L3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChfrQ810L3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChfrQ810L3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChfrQ810L3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ChfrQ810L3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChfrQ810L3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChfrQ810L3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChfrQ810L3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChfrQ810L3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChfrQ810L3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChfrQ810L3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChfrQ810L3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChfrQ810L3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChfrQ810L3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChfrQ810L3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChfrQ810L3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChfrQ810L3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChfrQ810L3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ChfrQ810L3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ChfrQ810L3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ChfrQ810L3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ChfrQ810L3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ChfrQ810L3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ChfrQ810L3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ChfrQ810L3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ChfrQ810L3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ChfrQ810L3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ChfrQ810L3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ChfrQ810L3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ChfrQ810L3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ChfrQ810L3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ChfrQ810L3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ChfrQ810L3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ChfrQ810L3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ChfrQ810L3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ChfrQ810L3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ChfrQ810L3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ChfrQ810L3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ChfrQ810L3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ChfrQ810L3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ChfrQ810L3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ChfrQ810L3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ChfrQ810L3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ChfrQ810L3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ChfrQ810L3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ChfrQ810L3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ChfrQ810L3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ChfrQ810L3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ChfrQ810L3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ChfrQ810L3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ChfrQ810L3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ChfrQ810L3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ChfrQ810L3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ChfrQ810L3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ChfrQ810L3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ChfrQ810L3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ChfrQ810L3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ChfrQ810L3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ChfrQ810L3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ChfrQ810L3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ChfrQ810L3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ChfrQ810L3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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ChfrQ810L3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ChfrQ810L3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ChfrQ810L3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ChfrQ810L3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ChfrQ810L3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ChfrQ810L3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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ChfrQ810L3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ChfrQ810L3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ChfrQ810L3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ChfrQ810L3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ChfrQ810L3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ChfrQ810L3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ChfrQ810L3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ChfrQ810L3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChfrQ810L3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChfrQ810L3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChfrQ810L3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChfrQ810L3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChfrQ810L3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChfrQ810L3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChfrQ810L3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ChfrQ810L3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChfrQ810L3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChfrQ810L3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChfrQ810L3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChfrQ810L3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChfrQ810L3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChfrQ810L3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChfrQ810L3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChfrQ810L3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChfrQ810L3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ChfrQ810L3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ChfrQ810L3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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