Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y84

Kdm5b, Lysine-specific demethylase 5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5bQ80Y84 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Kdm5bQ80Y84 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Kdm5bQ80Y84 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Kdm5bQ80Y84 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Kdm5bQ80Y84 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Kdm5bQ80Y84 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Kdm5bQ80Y84 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Kdm5bQ80Y84 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Kdm5bQ80Y84 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Kdm5bQ80Y84 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Kdm5bQ80Y84 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Kdm5bQ80Y84 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Kdm5bQ80Y84 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Kdm5bQ80Y84 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Kdm5bQ80Y84 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Kdm5bQ80Y84 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Kdm5bQ80Y84 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Kdm5bQ80Y84 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Kdm5bQ80Y84 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Kdm5bQ80Y84 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Kdm5bQ80Y84 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Kdm5bQ80Y84 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Kdm5bQ80Y84 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Kdm5bQ80Y84 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Kdm5bQ80Y84 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Kdm5bQ80Y84 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Kdm5bQ80Y84 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Kdm5bQ80Y84 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Kdm5bQ80Y84 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Kdm5bQ80Y84 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Kdm5bQ80Y84 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Kdm5bQ80Y84 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Kdm5bQ80Y84 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Kdm5bQ80Y84 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Kdm5bQ80Y84 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Kdm5bQ80Y84 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Kdm5bQ80Y84 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Kdm5bQ80Y84 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Kdm5bQ80Y84 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Kdm5bQ80Y84 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Kdm5bQ80Y84 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Kdm5bQ80Y84 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Kdm5bQ80Y84 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Kdm5bQ80Y84 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Kdm5bQ80Y84 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Kdm5bQ80Y84 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Kdm5bQ80Y84 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Kdm5bQ80Y84 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Kdm5bQ80Y84 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Kdm5bQ80Y84 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Kdm5bQ80Y84 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Kdm5bQ80Y84 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Kdm5bQ80Y84 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Kdm5bQ80Y84 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Kdm5bQ80Y84 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Kdm5bQ80Y84 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Kdm5bQ80Y84 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Kdm5bQ80Y84 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Kdm5bQ80Y84 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Kdm5bQ80Y84 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Kdm5bQ80Y84 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Kdm5bQ80Y84 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Kdm5bQ80Y84 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Kdm5bQ80Y84 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Kdm5bQ80Y84 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Kdm5bQ80Y84 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Kdm5bQ80Y84 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Kdm5bQ80Y84 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Kdm5bQ80Y84 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Kdm5bQ80Y84 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Kdm5bQ80Y84 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Kdm5bQ80Y84 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Kdm5bQ80Y84 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Kdm5bQ80Y84 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Kdm5bQ80Y84 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Kdm5bQ80Y84 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Kdm5bQ80Y84 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Kdm5bQ80Y84 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Kdm5bQ80Y84 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Kdm5bQ80Y84 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Kdm5bQ80Y84 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Kdm5bQ80Y84 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Kdm5bQ80Y84 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Kdm5bQ80Y84 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Kdm5bQ80Y84 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Kdm5bQ80Y84 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Kdm5bQ80Y84 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Kdm5bQ80Y84 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Kdm5bQ80Y84 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Kdm5bQ80Y84 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Kdm5bQ80Y84 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Kdm5bQ80Y84 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Kdm5bQ80Y84 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Kdm5bQ80Y84 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Kdm5bQ80Y84 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Kdm5bQ80Y84 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Kdm5bQ80Y84 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Kdm5bQ80Y84 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Kdm5bQ80Y84 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Kdm5bQ80Y84 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms