Protein–RNA interactions for Protein: Q80VJ8

Ccdc155, Protein KASH5, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc155Q80VJ8 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc155Q80VJ8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc155Q80VJ8 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc155Q80VJ8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc155Q80VJ8 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc155Q80VJ8 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc155Q80VJ8 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc155Q80VJ8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc155Q80VJ8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc155Q80VJ8 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc155Q80VJ8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc155Q80VJ8 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc155Q80VJ8 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc155Q80VJ8 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc155Q80VJ8 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc155Q80VJ8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc155Q80VJ8 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc155Q80VJ8 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc155Q80VJ8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc155Q80VJ8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc155Q80VJ8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc155Q80VJ8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc155Q80VJ8 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc155Q80VJ8 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc155Q80VJ8 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc155Q80VJ8 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc155Q80VJ8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc155Q80VJ8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc155Q80VJ8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc155Q80VJ8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc155Q80VJ8 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc155Q80VJ8 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc155Q80VJ8 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc155Q80VJ8 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc155Q80VJ8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc155Q80VJ8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc155Q80VJ8 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc155Q80VJ8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc155Q80VJ8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc155Q80VJ8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc155Q80VJ8 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc155Q80VJ8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc155Q80VJ8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc155Q80VJ8 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc155Q80VJ8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc155Q80VJ8 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc155Q80VJ8 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc155Q80VJ8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc155Q80VJ8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc155Q80VJ8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc155Q80VJ8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc155Q80VJ8 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc155Q80VJ8 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc155Q80VJ8 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc155Q80VJ8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc155Q80VJ8 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc155Q80VJ8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc155Q80VJ8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc155Q80VJ8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc155Q80VJ8 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc155Q80VJ8 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc155Q80VJ8 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc155Q80VJ8 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc155Q80VJ8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc155Q80VJ8 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc155Q80VJ8 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc155Q80VJ8 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc155Q80VJ8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc155Q80VJ8 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc155Q80VJ8 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc155Q80VJ8 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc155Q80VJ8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc155Q80VJ8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc155Q80VJ8 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc155Q80VJ8 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc155Q80VJ8 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc155Q80VJ8 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc155Q80VJ8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc155Q80VJ8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc155Q80VJ8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc155Q80VJ8 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc155Q80VJ8 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc155Q80VJ8 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc155Q80VJ8 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc155Q80VJ8 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc155Q80VJ8 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc155Q80VJ8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc155Q80VJ8 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc155Q80VJ8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc155Q80VJ8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc155Q80VJ8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc155Q80VJ8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc155Q80VJ8 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc155Q80VJ8 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc155Q80VJ8 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc155Q80VJ8 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc155Q80VJ8 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc155Q80VJ8 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc155Q80VJ8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc155Q80VJ8 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms