Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms