Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPY4

Pramel5, Pramel5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel5Q7TPY4 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pramel5Q7TPY4 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pramel5Q7TPY4 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramel5Q7TPY4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramel5Q7TPY4 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramel5Q7TPY4 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramel5Q7TPY4 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramel5Q7TPY4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramel5Q7TPY4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramel5Q7TPY4 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramel5Q7TPY4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramel5Q7TPY4 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramel5Q7TPY4 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramel5Q7TPY4 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramel5Q7TPY4 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramel5Q7TPY4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramel5Q7TPY4 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramel5Q7TPY4 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramel5Q7TPY4 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramel5Q7TPY4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramel5Q7TPY4 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramel5Q7TPY4 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramel5Q7TPY4 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramel5Q7TPY4 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramel5Q7TPY4 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramel5Q7TPY4 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramel5Q7TPY4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramel5Q7TPY4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramel5Q7TPY4 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramel5Q7TPY4 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramel5Q7TPY4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramel5Q7TPY4 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramel5Q7TPY4 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramel5Q7TPY4 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramel5Q7TPY4 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramel5Q7TPY4 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramel5Q7TPY4 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramel5Q7TPY4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramel5Q7TPY4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramel5Q7TPY4 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramel5Q7TPY4 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramel5Q7TPY4 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramel5Q7TPY4 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramel5Q7TPY4 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramel5Q7TPY4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramel5Q7TPY4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramel5Q7TPY4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramel5Q7TPY4 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramel5Q7TPY4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramel5Q7TPY4 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramel5Q7TPY4 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramel5Q7TPY4 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramel5Q7TPY4 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramel5Q7TPY4 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramel5Q7TPY4 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramel5Q7TPY4 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramel5Q7TPY4 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramel5Q7TPY4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramel5Q7TPY4 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramel5Q7TPY4 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramel5Q7TPY4 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramel5Q7TPY4 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramel5Q7TPY4 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pramel5Q7TPY4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pramel5Q7TPY4 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pramel5Q7TPY4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pramel5Q7TPY4 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pramel5Q7TPY4 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pramel5Q7TPY4 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pramel5Q7TPY4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pramel5Q7TPY4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pramel5Q7TPY4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pramel5Q7TPY4 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pramel5Q7TPY4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pramel5Q7TPY4 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pramel5Q7TPY4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramel5Q7TPY4 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramel5Q7TPY4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramel5Q7TPY4 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramel5Q7TPY4 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramel5Q7TPY4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramel5Q7TPY4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramel5Q7TPY4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramel5Q7TPY4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramel5Q7TPY4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramel5Q7TPY4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramel5Q7TPY4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramel5Q7TPY4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramel5Q7TPY4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramel5Q7TPY4 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramel5Q7TPY4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramel5Q7TPY4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramel5Q7TPY4 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramel5Q7TPY4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramel5Q7TPY4 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramel5Q7TPY4 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramel5Q7TPY4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramel5Q7TPY4 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramel5Q7TPY4 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramel5Q7TPY4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms