Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQA6

Igsf3, Immunoglobulin superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf3Q6ZQA6 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Igsf3Q6ZQA6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Igsf3Q6ZQA6 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Igsf3Q6ZQA6 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Igsf3Q6ZQA6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Igsf3Q6ZQA6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Igsf3Q6ZQA6 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Igsf3Q6ZQA6 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Igsf3Q6ZQA6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Igsf3Q6ZQA6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Igsf3Q6ZQA6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Igsf3Q6ZQA6 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Igsf3Q6ZQA6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Igsf3Q6ZQA6 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Igsf3Q6ZQA6 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Igsf3Q6ZQA6 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Igsf3Q6ZQA6 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Igsf3Q6ZQA6 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Igsf3Q6ZQA6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Igsf3Q6ZQA6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Igsf3Q6ZQA6 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Igsf3Q6ZQA6 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Igsf3Q6ZQA6 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Igsf3Q6ZQA6 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Igsf3Q6ZQA6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Igsf3Q6ZQA6 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Igsf3Q6ZQA6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Igsf3Q6ZQA6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Igsf3Q6ZQA6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Igsf3Q6ZQA6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Igsf3Q6ZQA6 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Igsf3Q6ZQA6 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Igsf3Q6ZQA6 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Igsf3Q6ZQA6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Igsf3Q6ZQA6 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Igsf3Q6ZQA6 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Igsf3Q6ZQA6 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Igsf3Q6ZQA6 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Igsf3Q6ZQA6 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Igsf3Q6ZQA6 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Igsf3Q6ZQA6 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Igsf3Q6ZQA6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Igsf3Q6ZQA6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Igsf3Q6ZQA6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Igsf3Q6ZQA6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Igsf3Q6ZQA6 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Igsf3Q6ZQA6 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Igsf3Q6ZQA6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Igsf3Q6ZQA6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Igsf3Q6ZQA6 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Igsf3Q6ZQA6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Igsf3Q6ZQA6 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Igsf3Q6ZQA6 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Igsf3Q6ZQA6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Igsf3Q6ZQA6 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Igsf3Q6ZQA6 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Igsf3Q6ZQA6 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Igsf3Q6ZQA6 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Igsf3Q6ZQA6 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Igsf3Q6ZQA6 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Igsf3Q6ZQA6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Igsf3Q6ZQA6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Igsf3Q6ZQA6 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Igsf3Q6ZQA6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Igsf3Q6ZQA6 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Igsf3Q6ZQA6 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Igsf3Q6ZQA6 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Igsf3Q6ZQA6 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Igsf3Q6ZQA6 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Igsf3Q6ZQA6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Igsf3Q6ZQA6 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Igsf3Q6ZQA6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Igsf3Q6ZQA6 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Igsf3Q6ZQA6 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Igsf3Q6ZQA6 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Igsf3Q6ZQA6 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Igsf3Q6ZQA6 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Igsf3Q6ZQA6 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Igsf3Q6ZQA6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Igsf3Q6ZQA6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Igsf3Q6ZQA6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Igsf3Q6ZQA6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Igsf3Q6ZQA6 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Igsf3Q6ZQA6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Igsf3Q6ZQA6 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Igsf3Q6ZQA6 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Igsf3Q6ZQA6 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Igsf3Q6ZQA6 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Igsf3Q6ZQA6 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Igsf3Q6ZQA6 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Igsf3Q6ZQA6 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Igsf3Q6ZQA6 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Igsf3Q6ZQA6 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Igsf3Q6ZQA6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Igsf3Q6ZQA6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Igsf3Q6ZQA6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Igsf3Q6ZQA6 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Igsf3Q6ZQA6 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Igsf3Q6ZQA6 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Igsf3Q6ZQA6 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms