Protein–RNA interactions for Protein: Q6VUP9

Tfap2e, Transcription factor AP-2-epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2eQ6VUP9 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tfap2eQ6VUP9 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Tfap2eQ6VUP9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tfap2eQ6VUP9 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tfap2eQ6VUP9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tfap2eQ6VUP9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tfap2eQ6VUP9 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tfap2eQ6VUP9 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tfap2eQ6VUP9 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tfap2eQ6VUP9 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tfap2eQ6VUP9 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tfap2eQ6VUP9 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tfap2eQ6VUP9 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tfap2eQ6VUP9 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tfap2eQ6VUP9 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tfap2eQ6VUP9 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Tfap2eQ6VUP9 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tfap2eQ6VUP9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tfap2eQ6VUP9 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Tfap2eQ6VUP9 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tfap2eQ6VUP9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tfap2eQ6VUP9 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tfap2eQ6VUP9 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tfap2eQ6VUP9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tfap2eQ6VUP9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tfap2eQ6VUP9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tfap2eQ6VUP9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tfap2eQ6VUP9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tfap2eQ6VUP9 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tfap2eQ6VUP9 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Tfap2eQ6VUP9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tfap2eQ6VUP9 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tfap2eQ6VUP9 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tfap2eQ6VUP9 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tfap2eQ6VUP9 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Tfap2eQ6VUP9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tfap2eQ6VUP9 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tfap2eQ6VUP9 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tfap2eQ6VUP9 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tfap2eQ6VUP9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tfap2eQ6VUP9 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tfap2eQ6VUP9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tfap2eQ6VUP9 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tfap2eQ6VUP9 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tfap2eQ6VUP9 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tfap2eQ6VUP9 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tfap2eQ6VUP9 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tfap2eQ6VUP9 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tfap2eQ6VUP9 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Tfap2eQ6VUP9 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tfap2eQ6VUP9 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tfap2eQ6VUP9 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tfap2eQ6VUP9 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tfap2eQ6VUP9 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tfap2eQ6VUP9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Tfap2eQ6VUP9 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tfap2eQ6VUP9 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tfap2eQ6VUP9 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tfap2eQ6VUP9 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tfap2eQ6VUP9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tfap2eQ6VUP9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tfap2eQ6VUP9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tfap2eQ6VUP9 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tfap2eQ6VUP9 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tfap2eQ6VUP9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tfap2eQ6VUP9 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tfap2eQ6VUP9 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tfap2eQ6VUP9 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tfap2eQ6VUP9 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tfap2eQ6VUP9 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tfap2eQ6VUP9 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tfap2eQ6VUP9 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tfap2eQ6VUP9 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tfap2eQ6VUP9 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tfap2eQ6VUP9 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tfap2eQ6VUP9 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tfap2eQ6VUP9 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tfap2eQ6VUP9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tfap2eQ6VUP9 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tfap2eQ6VUP9 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tfap2eQ6VUP9 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tfap2eQ6VUP9 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tfap2eQ6VUP9 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tfap2eQ6VUP9 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tfap2eQ6VUP9 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tfap2eQ6VUP9 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tfap2eQ6VUP9 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tfap2eQ6VUP9 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tfap2eQ6VUP9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tfap2eQ6VUP9 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tfap2eQ6VUP9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tfap2eQ6VUP9 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tfap2eQ6VUP9 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tfap2eQ6VUP9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tfap2eQ6VUP9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tfap2eQ6VUP9 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tfap2eQ6VUP9 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tfap2eQ6VUP9 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tfap2eQ6VUP9 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tfap2eQ6VUP9 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms