Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH4

Gcsam, Germinal center-associated signaling and motility protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcsamQ6RFH4 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GcsamQ6RFH4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GcsamQ6RFH4 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GcsamQ6RFH4 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GcsamQ6RFH4 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GcsamQ6RFH4 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GcsamQ6RFH4 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GcsamQ6RFH4 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GcsamQ6RFH4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GcsamQ6RFH4 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GcsamQ6RFH4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GcsamQ6RFH4 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GcsamQ6RFH4 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GcsamQ6RFH4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GcsamQ6RFH4 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GcsamQ6RFH4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GcsamQ6RFH4 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GcsamQ6RFH4 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GcsamQ6RFH4 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GcsamQ6RFH4 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GcsamQ6RFH4 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GcsamQ6RFH4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GcsamQ6RFH4 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GcsamQ6RFH4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GcsamQ6RFH4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GcsamQ6RFH4 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GcsamQ6RFH4 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GcsamQ6RFH4 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GcsamQ6RFH4 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GcsamQ6RFH4 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GcsamQ6RFH4 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GcsamQ6RFH4 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GcsamQ6RFH4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GcsamQ6RFH4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GcsamQ6RFH4 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GcsamQ6RFH4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GcsamQ6RFH4 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GcsamQ6RFH4 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GcsamQ6RFH4 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GcsamQ6RFH4 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GcsamQ6RFH4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GcsamQ6RFH4 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GcsamQ6RFH4 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GcsamQ6RFH4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GcsamQ6RFH4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GcsamQ6RFH4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GcsamQ6RFH4 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GcsamQ6RFH4 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GcsamQ6RFH4 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GcsamQ6RFH4 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GcsamQ6RFH4 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GcsamQ6RFH4 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GcsamQ6RFH4 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GcsamQ6RFH4 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GcsamQ6RFH4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GcsamQ6RFH4 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GcsamQ6RFH4 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GcsamQ6RFH4 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GcsamQ6RFH4 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GcsamQ6RFH4 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GcsamQ6RFH4 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GcsamQ6RFH4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GcsamQ6RFH4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GcsamQ6RFH4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GcsamQ6RFH4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GcsamQ6RFH4 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GcsamQ6RFH4 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GcsamQ6RFH4 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GcsamQ6RFH4 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GcsamQ6RFH4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GcsamQ6RFH4 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GcsamQ6RFH4 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GcsamQ6RFH4 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GcsamQ6RFH4 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GcsamQ6RFH4 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GcsamQ6RFH4 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GcsamQ6RFH4 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GcsamQ6RFH4 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GcsamQ6RFH4 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GcsamQ6RFH4 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GcsamQ6RFH4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GcsamQ6RFH4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GcsamQ6RFH4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GcsamQ6RFH4 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GcsamQ6RFH4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GcsamQ6RFH4 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GcsamQ6RFH4 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GcsamQ6RFH4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GcsamQ6RFH4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GcsamQ6RFH4 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GcsamQ6RFH4 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GcsamQ6RFH4 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GcsamQ6RFH4 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GcsamQ6RFH4 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GcsamQ6RFH4 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GcsamQ6RFH4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GcsamQ6RFH4 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GcsamQ6RFH4 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GcsamQ6RFH4 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GcsamQ6RFH4 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms