Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rad54bQ6PFE3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rad54bQ6PFE3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rad54bQ6PFE3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rad54bQ6PFE3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rad54bQ6PFE3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rad54bQ6PFE3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rad54bQ6PFE3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rad54bQ6PFE3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rad54bQ6PFE3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rad54bQ6PFE3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rad54bQ6PFE3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rad54bQ6PFE3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rad54bQ6PFE3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rad54bQ6PFE3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rad54bQ6PFE3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rad54bQ6PFE3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rad54bQ6PFE3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rad54bQ6PFE3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rad54bQ6PFE3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rad54bQ6PFE3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rad54bQ6PFE3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rad54bQ6PFE3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rad54bQ6PFE3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rad54bQ6PFE3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rad54bQ6PFE3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rad54bQ6PFE3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Rad54bQ6PFE3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rad54bQ6PFE3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rad54bQ6PFE3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rad54bQ6PFE3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rad54bQ6PFE3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rad54bQ6PFE3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rad54bQ6PFE3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rad54bQ6PFE3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Rad54bQ6PFE3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rad54bQ6PFE3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Rad54bQ6PFE3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rad54bQ6PFE3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rad54bQ6PFE3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rad54bQ6PFE3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rad54bQ6PFE3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rad54bQ6PFE3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rad54bQ6PFE3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad54bQ6PFE3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad54bQ6PFE3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad54bQ6PFE3 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad54bQ6PFE3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad54bQ6PFE3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad54bQ6PFE3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad54bQ6PFE3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad54bQ6PFE3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad54bQ6PFE3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad54bQ6PFE3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad54bQ6PFE3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad54bQ6PFE3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad54bQ6PFE3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad54bQ6PFE3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad54bQ6PFE3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad54bQ6PFE3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad54bQ6PFE3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad54bQ6PFE3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad54bQ6PFE3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad54bQ6PFE3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad54bQ6PFE3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad54bQ6PFE3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad54bQ6PFE3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad54bQ6PFE3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad54bQ6PFE3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad54bQ6PFE3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad54bQ6PFE3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad54bQ6PFE3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad54bQ6PFE3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad54bQ6PFE3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad54bQ6PFE3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad54bQ6PFE3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad54bQ6PFE3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad54bQ6PFE3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rad54bQ6PFE3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rad54bQ6PFE3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rad54bQ6PFE3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rad54bQ6PFE3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rad54bQ6PFE3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rad54bQ6PFE3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rad54bQ6PFE3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rad54bQ6PFE3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rad54bQ6PFE3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rad54bQ6PFE3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rad54bQ6PFE3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rad54bQ6PFE3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rad54bQ6PFE3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rad54bQ6PFE3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rad54bQ6PFE3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rad54bQ6PFE3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rad54bQ6PFE3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rad54bQ6PFE3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rad54bQ6PFE3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rad54bQ6PFE3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rad54bQ6PFE3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rad54bQ6PFE3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms