Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDQ2

Chd4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd4Q6PDQ2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chd4Q6PDQ2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chd4Q6PDQ2 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chd4Q6PDQ2 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chd4Q6PDQ2 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chd4Q6PDQ2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chd4Q6PDQ2 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chd4Q6PDQ2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chd4Q6PDQ2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chd4Q6PDQ2 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chd4Q6PDQ2 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chd4Q6PDQ2 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chd4Q6PDQ2 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chd4Q6PDQ2 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chd4Q6PDQ2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chd4Q6PDQ2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chd4Q6PDQ2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chd4Q6PDQ2 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chd4Q6PDQ2 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chd4Q6PDQ2 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chd4Q6PDQ2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chd4Q6PDQ2 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chd4Q6PDQ2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chd4Q6PDQ2 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chd4Q6PDQ2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Chd4Q6PDQ2 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chd4Q6PDQ2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chd4Q6PDQ2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chd4Q6PDQ2 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chd4Q6PDQ2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Chd4Q6PDQ2 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Chd4Q6PDQ2 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Chd4Q6PDQ2 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Chd4Q6PDQ2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Chd4Q6PDQ2 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Chd4Q6PDQ2 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Chd4Q6PDQ2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chd4Q6PDQ2 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chd4Q6PDQ2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chd4Q6PDQ2 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chd4Q6PDQ2 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chd4Q6PDQ2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chd4Q6PDQ2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chd4Q6PDQ2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chd4Q6PDQ2 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chd4Q6PDQ2 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Chd4Q6PDQ2 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chd4Q6PDQ2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chd4Q6PDQ2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chd4Q6PDQ2 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chd4Q6PDQ2 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chd4Q6PDQ2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chd4Q6PDQ2 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chd4Q6PDQ2 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Chd4Q6PDQ2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chd4Q6PDQ2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chd4Q6PDQ2 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chd4Q6PDQ2 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chd4Q6PDQ2 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chd4Q6PDQ2 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chd4Q6PDQ2 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chd4Q6PDQ2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chd4Q6PDQ2 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chd4Q6PDQ2 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chd4Q6PDQ2 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chd4Q6PDQ2 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chd4Q6PDQ2 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chd4Q6PDQ2 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chd4Q6PDQ2 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chd4Q6PDQ2 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chd4Q6PDQ2 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chd4Q6PDQ2 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chd4Q6PDQ2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chd4Q6PDQ2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chd4Q6PDQ2 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chd4Q6PDQ2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chd4Q6PDQ2 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chd4Q6PDQ2 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chd4Q6PDQ2 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chd4Q6PDQ2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chd4Q6PDQ2 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chd4Q6PDQ2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chd4Q6PDQ2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chd4Q6PDQ2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chd4Q6PDQ2 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chd4Q6PDQ2 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Chd4Q6PDQ2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chd4Q6PDQ2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chd4Q6PDQ2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chd4Q6PDQ2 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chd4Q6PDQ2 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chd4Q6PDQ2 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chd4Q6PDQ2 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chd4Q6PDQ2 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chd4Q6PDQ2 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chd4Q6PDQ2 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chd4Q6PDQ2 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chd4Q6PDQ2 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chd4Q6PDQ2 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Chd4Q6PDQ2 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms